226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3066 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
355 aa  700    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  31.83 
 
 
354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  25.43 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3416  permease YjgP/YjgQ family protein  30.75 
 
 
377 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  28.21 
 
 
358 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  28.22 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  31.69 
 
 
350 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.8 
 
 
354 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  25.86 
 
 
387 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  25.83 
 
 
353 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  29.17 
 
 
357 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  26.04 
 
 
358 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  28.04 
 
 
356 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  25.14 
 
 
352 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  24.29 
 
 
353 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 
354 aa  99.4  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.78 
 
 
359 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  29.39 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  22.9 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  21.19 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  30.23 
 
 
362 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  21.47 
 
 
356 aa  95.9  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  27.59 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  21.16 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  24.93 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  23.41 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  28.1 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  24.36 
 
 
356 aa  92.8  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  24.07 
 
 
353 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  28.75 
 
 
368 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 
397 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 
369 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  25.71 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  26.58 
 
 
359 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  28.35 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.57 
 
 
371 aa  89.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  22.9 
 
 
401 aa  89.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 
352 aa  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  27.48 
 
 
359 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  27.54 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  25.24 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  27.54 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  25 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  24.08 
 
 
356 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  25 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  25 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  25 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  25 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  27.06 
 
 
359 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  26.12 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  25.91 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  24.44 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  23.5 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 
376 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  23.06 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  23.92 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  24.52 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  23.13 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  23.77 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  23.77 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  23.77 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  23.24 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  23.77 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  23.77 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  23.77 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  24.43 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  22.76 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  21.91 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  24.38 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  23.77 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  23.28 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  23.28 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>