203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3025 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3025  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
389 aa  806    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0384  glycosyl transferase group 1  42.11 
 
 
392 aa  315  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0758  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
392 aa  206  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2434  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0597525  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  25.78 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
820 aa  66.6  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
505 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  26.14 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13881  hypothetical protein  23.48 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.812309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  25.45 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
379 aa  57.4  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
394 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
871 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
386 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  29.45 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  25.69 
 
 
415 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0110  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.19 
 
 
346 aa  53.1  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000484936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
406 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  28.33 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.22 
 
 
427 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
390 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1918  UDP-glucose:tetrahydrobiopterin glucosyltransferase  29.27 
 
 
359 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
384 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 
378 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
409 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
468 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1146  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00446094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
639 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
461 aa  50.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.08 
 
 
383 aa  49.7  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3275  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
352 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2824  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
352 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
827 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  27.62 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  29.6 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
568 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1814  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.506026  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
400 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
400 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0585  putative UDP-glucose:tetrahydrobiopterin glucosyltransferase  26.84 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4404  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983503  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 
364 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
503 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.53 
 
 
775 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
410 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
375 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 
358 aa  46.6  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
365 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
412 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.15 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
518 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  25.77 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.93 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0922  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
505 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1261  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0797  glycosyltransferase  26.71 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3225  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503811  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  28.89 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>