64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2957 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  209  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  89 
 
 		 107 aa  183  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  88.89 
 
 		 106 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  86.54 
 
 		 106 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  66.33 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  63.73 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  64.58 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0494  hypothetical protein  83.67 
 
 		 63 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3123  putative transcriptional regulator  47.44 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2079  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0368  addiction module antidote protein  46.25 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2621  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3351  putative transcriptional regulator  61.22 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00224637  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  41.03 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3002  addiction module antidote protein  39.56 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3348  putative transcriptional regulator  76.32 
 
 		 40 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767787  normal  0.423432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0224  putative transcriptional regulator  40.22 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4949  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5375  hypothetical protein  29.79 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00339875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3155  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1150  hypothetical protein  42.31 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0829  hypothetical protein  35.16 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00761962 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0017  hypothetical protein  33.68 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.447593  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0856  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.623315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3926  putative transcriptional regulator  37.18 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.511666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2670  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  30.39 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4548  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2007  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1201  addiction module antidote protein  29.63 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000259095  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1426  addiction module antidote protein  29.63 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00137891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0051  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2993  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2280  transcriptional regulator-like  35.14 
 
 		 305 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  0.372156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0456  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1686  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3881  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.26577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40590  transcriptional regulator protein  33.7 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3174  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9109  hypothetical protein  32.89 
 
 		 286 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0861  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1734  hypothetical protein  34.12 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1424  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.356801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8270  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0213067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0174  putative addiction module antidote protein  30.43 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0366  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0449  hypothetical protein  34.09 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1725  putative transcriptional regulator  45.24 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0282  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6313  addiction module antidote protein  28.42 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0276744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4018  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0184  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.57004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6941  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3082  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1577  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>