More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2898 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  100 
 
 
75 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  100 
 
 
75 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  89.33 
 
 
75 aa  145  2e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  89.33 
 
 
75 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  84 
 
 
75 aa  135  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  82.67 
 
 
75 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  82.67 
 
 
75 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  81.33 
 
 
77 aa  132  1e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  80 
 
 
75 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  78.67 
 
 
75 aa  127  5e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  80.26 
 
 
76 aa  123  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  70.67 
 
 
75 aa  116  1e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  70.67 
 
 
75 aa  116  1e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  70.67 
 
 
75 aa  116  1e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  70.67 
 
 
75 aa  116  1e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  70.67 
 
 
75 aa  116  1e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  70.67 
 
 
75 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  70.67 
 
 
75 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  69.74 
 
 
76 aa  112  2e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  69.74 
 
 
76 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  69.74 
 
 
76 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  69.74 
 
 
76 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  69.74 
 
 
76 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  69.74 
 
 
76 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  69.74 
 
 
76 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  69.74 
 
 
76 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  66.67 
 
 
75 aa  111  4e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  65.33 
 
 
75 aa  110  7e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  65.79 
 
 
78 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  66.67 
 
 
77 aa  107  7e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  64 
 
 
77 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  64 
 
 
75 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  64 
 
 
75 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  64 
 
 
75 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  57.33 
 
 
75 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  7.89219e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  60 
 
 
75 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  56 
 
 
75 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  59.21 
 
 
76 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  56.16 
 
 
76 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  53.42 
 
 
76 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  56.96 
 
 
82 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  56 
 
 
81 aa  94.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  58.57 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  2.14154e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  58.57 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  54.79 
 
 
81 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  52 
 
 
76 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  57.14 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  54.29 
 
 
74 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  5.91857e-07 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  50.68 
 
 
76 aa  82.8  1e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  47.83 
 
 
76 aa  77.8  4e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.19157e-05  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  52.17 
 
 
83 aa  77.8  5e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  48.57 
 
 
78 aa  77.8  5e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  6.71264e-06  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  52.86 
 
 
83 aa  77.4  6e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  51.43 
 
 
83 aa  77  8e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69267e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  52.17 
 
 
83 aa  77  9e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  50.72 
 
 
83 aa  77  9e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  49.28 
 
 
79 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  49.28 
 
 
79 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  49.28 
 
 
79 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  44.93 
 
 
77 aa  75.5  2e-13  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  49.28 
 
 
79 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  45.71 
 
 
78 aa  75.1  3e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  7.71633e-05  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  44.29 
 
 
77 aa  73.9  6e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  38.89 
 
 
78 aa  72.8  1e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  6.89982e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  44.29 
 
 
78 aa  73.2  1e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  1.75689e-05  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0815  SirA family protein  39.24 
 
 
83 aa  72.4  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  43.84 
 
 
84 aa  71.6  3e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  40.54 
 
 
81 aa  71.6  3e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  46.38 
 
 
79 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  50.75 
 
 
78 aa  71.6  4e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  43.84 
 
 
81 aa  71.2  5e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  44.93 
 
 
81 aa  70.5  7e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1186  SirA family protein  39.24 
 
 
83 aa  70.5  8e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  44.29 
 
 
103 aa  70.1  9e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  3.73287e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1151  SirA family protein  42.47 
 
 
82 aa  69.7  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  4.31331e-08  decreased coverage  2.5153e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  41.89 
 
 
80 aa  69.7  1e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  49.28 
 
 
85 aa  69.7  1e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  40.54 
 
 
81 aa  69.7  1e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  39.71 
 
 
186 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  39.71 
 
 
186 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.26035e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  44.12 
 
 
85 aa  68.6  3e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  47.83 
 
 
79 aa  68.6  3e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  45.21 
 
 
80 aa  67.8  4e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  43.28 
 
 
76 aa  67.8  4e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.95023e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  39.71 
 
 
186 aa  67.8  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  39.71 
 
 
186 aa  67.4  6e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  39.71 
 
 
186 aa  67.4  6e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47313e-12 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  42.65 
 
 
189 aa  67  8e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.44688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  38.24 
 
 
194 aa  66.6  1e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  42.03 
 
 
213 aa  66.2  1e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  41.33 
 
 
201 aa  66.2  2e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  40.32 
 
 
75 aa  65.5  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  45.59 
 
 
83 aa  65.5  3e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
186 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
186 aa  65.1  3e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
186 aa  65.1  3e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  36.76 
 
 
186 aa  64.7  4e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.93639e-08 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  44.93 
 
 
92 aa  64.7  4e-10  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  40.58 
 
 
79 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  37.88 
 
 
76 aa  63.5  1e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17975e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>