More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2691 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  76.99 
 
 
452 aa  725    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  70.13 
 
 
453 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
452 aa  928    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  68.74 
 
 
452 aa  634    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  64.08 
 
 
452 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  65.32 
 
 
453 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  60.53 
 
 
455 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  59.29 
 
 
455 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  59.42 
 
 
455 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  59.65 
 
 
455 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  56.76 
 
 
452 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  56.76 
 
 
452 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  55.53 
 
 
470 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  57.43 
 
 
452 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  56.98 
 
 
454 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  56.35 
 
 
454 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  59.73 
 
 
454 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  59.73 
 
 
454 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  56.57 
 
 
472 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  57.56 
 
 
473 aa  520  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  57.08 
 
 
454 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  57.17 
 
 
468 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  57.08 
 
 
454 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  57.3 
 
 
477 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  56.98 
 
 
470 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  56.54 
 
 
467 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  57.3 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  57.52 
 
 
472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  57.3 
 
 
459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  54.77 
 
 
452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  57.52 
 
 
603 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  56.86 
 
 
454 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  57.3 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  57.3 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  53.86 
 
 
453 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  57.21 
 
 
589 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  55.43 
 
 
454 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  55.43 
 
 
454 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  54.75 
 
 
455 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  55.51 
 
 
452 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  54.32 
 
 
454 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  54.22 
 
 
461 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  54.42 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  54.08 
 
 
457 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  52.13 
 
 
452 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  52.29 
 
 
460 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.18 
 
 
460 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  51.97 
 
 
460 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  51.76 
 
 
468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  51.19 
 
 
461 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  49.01 
 
 
451 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  46.93 
 
 
460 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  44.14 
 
 
476 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.97 
 
 
536 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  41.28 
 
 
467 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.98 
 
 
525 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  42.55 
 
 
525 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  41.16 
 
 
468 aa  365  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 
524 aa  363  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  42.55 
 
 
470 aa  359  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  40.64 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  42.7 
 
 
469 aa  355  7.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  42.49 
 
 
544 aa  351  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.95 
 
 
543 aa  350  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  38.84 
 
 
522 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.52 
 
 
469 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.76 
 
 
541 aa  346  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.51 
 
 
469 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  39.19 
 
 
535 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 
464 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.62 
 
 
474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.05 
 
 
471 aa  340  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.48 
 
 
530 aa  335  7.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.05 
 
 
540 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.26 
 
 
464 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  36.72 
 
 
570 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 
465 aa  320  5e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 
536 aa  316  6e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.18 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 
536 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 
536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  38.9 
 
 
462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  37.85 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  39.19 
 
 
466 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  39.69 
 
 
532 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.19 
 
 
466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  38.56 
 
 
468 aa  309  8e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  37.63 
 
 
467 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  38.63 
 
 
465 aa  309  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  37.39 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  37.96 
 
 
468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  40.58 
 
 
540 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  41.93 
 
 
542 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  39.83 
 
 
476 aa  306  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.47 
 
 
466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.44 
 
 
455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.6 
 
 
481 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
462 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>