More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2674 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2674  acetate kinase  100 
 
 
381 aa  767    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  54.19 
 
 
593 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  46.67 
 
 
589 aa  352  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  48.7 
 
 
583 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  39.85 
 
 
398 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  44.65 
 
 
380 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  38.94 
 
 
399 aa  295  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  38.73 
 
 
397 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  36.43 
 
 
404 aa  292  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  38.48 
 
 
396 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  38.18 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  40.1 
 
 
400 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  40.1 
 
 
400 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  38.9 
 
 
398 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  38.9 
 
 
398 aa  288  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  39.35 
 
 
405 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  37.59 
 
 
417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  37.66 
 
 
397 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  37.72 
 
 
397 aa  285  9e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  39.19 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  38.73 
 
 
397 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  45.34 
 
 
403 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  38.73 
 
 
397 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  38.73 
 
 
397 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  45.34 
 
 
403 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  35.43 
 
 
397 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  42.08 
 
 
394 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  38.93 
 
 
397 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  37.84 
 
 
397 aa  282  9e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  38.6 
 
 
398 aa  282  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  37.97 
 
 
397 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  37.97 
 
 
397 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  38.93 
 
 
397 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  35.43 
 
 
401 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  40.75 
 
 
414 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  37.97 
 
 
397 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  39.34 
 
 
772 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  36.66 
 
 
399 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  43.07 
 
 
399 aa  280  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  42.14 
 
 
402 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  38.4 
 
 
404 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  38.75 
 
 
397 aa  278  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  33.83 
 
 
397 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  40.45 
 
 
414 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  35.84 
 
 
398 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  38.61 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  37.56 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  41.9 
 
 
422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  36.25 
 
 
399 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  37.34 
 
 
417 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  37.34 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  42.86 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  37.59 
 
 
408 aa  272  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  37.97 
 
 
396 aa  272  8.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  37.63 
 
 
396 aa  272  9e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  37.34 
 
 
397 aa  272  9e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  35.61 
 
 
421 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  37.69 
 
 
398 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  37.59 
 
 
412 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  38.04 
 
 
400 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  36.88 
 
 
421 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  36.09 
 
 
398 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  37.75 
 
 
395 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  38.54 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  38.54 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  37.37 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  38.54 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  38.54 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  43.08 
 
 
406 aa  269  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  39.29 
 
 
402 aa  269  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  36.63 
 
 
421 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  36.66 
 
 
452 aa  268  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  37.22 
 
 
399 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  36.9 
 
 
398 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  41.41 
 
 
395 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  37.12 
 
 
399 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  37.22 
 
 
402 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  36.39 
 
 
421 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  40.51 
 
 
398 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  37.12 
 
 
399 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  37.12 
 
 
399 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  37.09 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  38.17 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  37.66 
 
 
404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  36.62 
 
 
396 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  37.66 
 
 
404 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  37.66 
 
 
404 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  37.66 
 
 
404 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  37.66 
 
 
404 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  35.41 
 
 
401 aa  266  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  36.57 
 
 
421 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  37.81 
 
 
406 aa  265  8.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  37.22 
 
 
399 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  36.21 
 
 
404 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  36.21 
 
 
404 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  36.25 
 
 
398 aa  263  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  41.6 
 
 
386 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  36.25 
 
 
405 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  38.31 
 
 
411 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  40.93 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>