More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2566 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  97.37 
 
 		 245 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  66.17 
 
 		 283 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  62.93 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  61.98 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  58.62 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  56.25 
 
 		 281 aa  244  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  56.94 
 
 		 261 aa  242  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  58.42 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  58.5 
 
 		 243 aa  232  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  55.78 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  55.28 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  58.79 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  57.79 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  54.77 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  57.79 
 
 		 229 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  57.79 
 
 		 229 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  57.29 
 
 		 254 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  57.29 
 
 		 254 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  57.29 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  55.78 
 
 		 253 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  55.78 
 
 		 253 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  55.78 
 
 		 253 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  55.78 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  55.78 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  55.78 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  55.78 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  55.88 
 
 		 235 aa  221  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  56.22 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  49.5 
 
 		 217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  56.28 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  55.45 
 
 		 203 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  51.38 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  48.1 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  50.46 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  50.46 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  50.46 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  53.89 
 
 		 243 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  52.26 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  49.76 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  36.72 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  35.71 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  36.13 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  37.5 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  37.5 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.1 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  36.56 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.83 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  36.57 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  36.51 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  36.57 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  36.57 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  36.05 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  37.72 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  34.66 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  35.84 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  33.92 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  31.94 
 
 		 203 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  32.6 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  32.6 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  32.95 
 
 		 318 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  39.11 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  39.11 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  35.11 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  34.88 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  34.57 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  34.88 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  35.11 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  33.89 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  32.39 
 
 		 208 aa  92  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 228 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  31.61 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  31.61 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  32.37 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  31.96 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  30.34 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  32.77 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  32.77 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  31.64 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  35.26 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  28.19 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  31.79 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  33.91 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  32.95 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  31.79 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>