More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2399 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2399  translation initiation factor 3  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1449  translation initiation factor IF-3  99.44 
 
 		 178 aa  358  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  91.33 
 
 		 173 aa  328  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  87.08 
 
 		 179 aa  323  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4615  translation initiation factor IF-3  87.8 
 
 		 205 aa  314  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550189  hitchhiker  0.00733617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  85.96 
 
 		 177 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  82.76 
 
 		 174 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  83.87 
 
 		 181 aa  279  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1337  translation initiation factor IF-3  85.29 
 
 		 171 aa  278  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  70 
 
 		 178 aa  250  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  68.24 
 
 		 173 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1887  translation initiation factor 3  78.12 
 
 		 160 aa  239  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729735  normal  0.011077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  65.29 
 
 		 173 aa  231  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  66.87 
 
 		 169 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  70.51 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  227  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 156 aa  227  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  67.95 
 
 		 156 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  67.95 
 
 		 156 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1009  translation initiation factor IF-3  66.27 
 
 		 169 aa  218  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  67.11 
 
 		 153 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  58.43 
 
 		 182 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  65.16 
 
 		 155 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  66.23 
 
 		 154 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  65.81 
 
 		 184 aa  210  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  61.93 
 
 		 180 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  60.61 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  60.61 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  60.61 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  60.61 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  58.08 
 
 		 171 aa  207  7e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  61.93 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  61.93 
 
 		 180 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  61.93 
 
 		 180 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 		 180 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  60.23 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  60.23 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  60.23 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  57.23 
 
 		 178 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  57.23 
 
 		 178 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 194 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 194 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  60.51 
 
 		 159 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  56.36 
 
 		 202 aa  197  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  58.79 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  56.4 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1713  translation initiation factor IF-3  59.22 
 
 		 183 aa  194  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000356147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  56.8 
 
 		 172 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  58.79 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  58.79 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  67.15 
 
 		 137 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  58.79 
 
 		 177 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 166 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  58.18 
 
 		 177 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 192 aa  191  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  56.41 
 
 		 156 aa  191  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1746  initiation factor 3  74.81 
 
 		 135 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00682554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2098  translation initiation factor IF-3  60 
 
 		 147 aa  188  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 		 177 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 		 172 aa  187  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2019  translation initiation factor IF-3  60 
 
 		 147 aa  187  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2490  translation initiation factor IF-3  55.23 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000196048  hitchhiker  0.0000835818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2031  translation initiation factor IF-3  56.4 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  hitchhiker  0.0000245728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 171 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2185  translation initiation factor IF-3  56.98 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000180897  normal  0.0386823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2221  translation initiation factor IF-3  56.98 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000103984  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 173 aa  185  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  57.41 
 
 		 197 aa  184  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 		 178 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 173 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  58.45 
 
 		 144 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  54.94 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1725  translation initiation factor IF-3  63.19 
 
 		 144 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00587564  normal  0.500746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 173 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  61.64 
 
 		 146 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  55.56 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2262  translation initiation factor IF-3  57.96 
 
 		 158 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000757605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  56.02 
 
 		 176 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>