More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2350 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1670  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.51 
 
 
605 aa  795    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.595012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0511  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  70.54 
 
 
614 aa  861    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2534  DNA-directed DNA polymerase  60.18 
 
 
614 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2350  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
679 aa  1353    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156854  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1457  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.49 
 
 
647 aa  829    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2268  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.4 
 
 
610 aa  760    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4903  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  86.07 
 
 
731 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742776  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  96.47 
 
 
678 aa  1165    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2330  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  67.11 
 
 
620 aa  807    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  75.44 
 
 
701 aa  922    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1976  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  76.49 
 
 
650 aa  572  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0621035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1191  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.53 
 
 
728 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.775033  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.77 
 
 
795 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1127  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.88 
 
 
733 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.8 
 
 
730 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1035  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.89 
 
 
731 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.430627  normal  0.544075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2361  DNA-directed DNA polymerase  62.23 
 
 
957 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832917  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1826  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.4 
 
 
893 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.31 
 
 
553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  61.46 
 
 
793 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1738  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.8 
 
 
813 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206235  normal  0.0482422 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6252  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.27 
 
 
787 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1765  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.8 
 
 
824 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1827  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.27 
 
 
787 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1446  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.8 
 
 
821 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223161  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.53 
 
 
793 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51542  normal  0.226661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5128  DNA polymerase III subunits gamma and tau  59.79 
 
 
791 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00417503  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.31 
 
 
558 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1361  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.76 
 
 
825 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.926406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2373  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.76 
 
 
822 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2219  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.76 
 
 
812 aa  459  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.76 
 
 
825 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0281713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0045  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.76 
 
 
825 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2206  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.76 
 
 
826 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.76 
 
 
825 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2244  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.49 
 
 
825 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  51.34 
 
 
572 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  57.42 
 
 
580 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.75 
 
 
694 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.85 
 
 
692 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.97 
 
 
716 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  58.27 
 
 
537 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  57.53 
 
 
687 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  54.88 
 
 
689 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002885  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.69 
 
 
701 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00493528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.63 
 
 
743 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  57.53 
 
 
736 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0572  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.95 
 
 
692 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000382536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.95 
 
 
637 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  56.57 
 
 
681 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  56.3 
 
 
701 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  56.99 
 
 
692 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.59 
 
 
690 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0515  DNA polymerase subunits gamma and tau  59.29 
 
 
581 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.28 
 
 
685 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.77 
 
 
690 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.39 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  55.43 
 
 
648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  38.74 
 
 
696 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.23 
 
 
736 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  54.99 
 
 
681 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.22 
 
 
591 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  51.63 
 
 
715 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.33 
 
 
678 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.09 
 
 
723 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  48.67 
 
 
955 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.72 
 
 
1071 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.72 
 
 
1045 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3198  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.14 
 
 
658 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.344651  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.17 
 
 
1137 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.72 
 
 
1137 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  50.63 
 
 
529 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.72 
 
 
957 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.36 
 
 
911 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1085  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.86 
 
 
714 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.88 
 
 
1115 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.35 
 
 
601 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3059  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.14 
 
 
658 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.72 
 
 
939 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.45 
 
 
1040 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  52.02 
 
 
1002 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2889  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39 
 
 
658 aa  389  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.381742  normal  0.068134 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.21 
 
 
543 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.03 
 
 
664 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.63 
 
 
948 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.45 
 
 
921 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.57 
 
 
642 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.9 
 
 
1147 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.37 
 
 
587 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.09 
 
 
774 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.13 
 
 
751 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325473  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.21 
 
 
1113 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.98 
 
 
650 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1310  DNA-directed DNA polymerase  48.01 
 
 
909 aa  382  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216995  normal  0.0673614 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.81 
 
 
643 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.81 
 
 
643 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.49 
 
 
752 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.81 
 
 
643 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.81 
 
 
643 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.43 
 
 
642 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>