22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2218 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2218  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 842 aa  1709    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.000600865  normal  0.100568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3083  TIR protein  22.85 
 
 		 824 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  37.93 
 
 		 291 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 468 aa  54.7  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1297 aa  52.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  27.27 
 
 		 413 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 430 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 302 aa  50.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1333  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 365 aa  50.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 1526 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 879 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  41.89 
 
 		 441 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  26.16 
 
 		 729 aa  48.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 1737 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 3145 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  26.59 
 
 		 299 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 258 aa  46.2  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  27.5 
 
 		 682 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 750 aa  45.8  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 400 aa  45.8  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 404 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 		 1022 aa  44.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>