61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2208 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  56.13 
 
 		 743 aa  815    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  74.85 
 
 		 708 aa  1065    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  69.62 
 
 		 743 aa  1061    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  98.05 
 
 		 718 aa  1436    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  61.66 
 
 		 706 aa  875    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1465    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  84.98 
 
 		 733 aa  1259    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  86.06 
 
 		 730 aa  1233    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  86.21 
 
 		 730 aa  1236    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  63.58 
 
 		 704 aa  877    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  87.39 
 
 		 730 aa  1269    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  54.63 
 
 		 664 aa  743    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  63.87 
 
 		 730 aa  892    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  63.87 
 
 		 704 aa  878    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  86 
 
 		 727 aa  1253    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  69.22 
 
 		 744 aa  1059    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  76.89 
 
 		 701 aa  1093    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  86.28 
 
 		 719 aa  1272    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  73.68 
 
 		 719 aa  1117    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  62.71 
 
 		 703 aa  889    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  84.58 
 
 		 719 aa  1249    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  56.56 
 
 		 708 aa  776    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  91.64 
 
 		 719 aa  1363    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  88.42 
 
 		 721 aa  1318    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  98.19 
 
 		 718 aa  1438    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  86.28 
 
 		 728 aa  1258    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  74.85 
 
 		 707 aa  1066    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  85.86 
 
 		 729 aa  1251    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  43.12 
 
 		 752 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  37.57 
 
 		 659 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  38.05 
 
 		 644 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  37.57 
 
 		 668 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  71.58 
 
 		 293 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  78.7 
 
 		 290 aa  362  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  30.8 
 
 		 621 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  31.55 
 
 		 637 aa  272  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  29.48 
 
 		 615 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  29.09 
 
 		 629 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  30.41 
 
 		 618 aa  248  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  30.41 
 
 		 618 aa  248  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  30.39 
 
 		 622 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  30.68 
 
 		 622 aa  243  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  28.53 
 
 		 635 aa  236  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  30.93 
 
 		 622 aa  234  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  28.55 
 
 		 635 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  29.1 
 
 		 629 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  28.72 
 
 		 633 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  28.28 
 
 		 635 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  27.84 
 
 		 650 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  27.66 
 
 		 635 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  25.89 
 
 		 624 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  23.08 
 
 		 464 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  22 
 
 		 457 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  22.59 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  21.93 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  22.12 
 
 		 589 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  24.18 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.06 
 
 		 557 aa  66.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  31.25 
 
 		 619 aa  52  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  22.27 
 
 		 786 aa  48.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  21.49 
 
 		 511 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>