112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2202 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  80.77 
 
 		 662 aa  1083    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  100 
 
 		 651 aa  1315    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  80.34 
 
 		 671 aa  1041    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  36.82 
 
 		 673 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  40.64 
 
 		 609 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  28.61 
 
 		 698 aa  106  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  28.92 
 
 		 361 aa  104  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  37.98 
 
 		 702 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  25 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  29.03 
 
 		 773 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  25.15 
 
 		 946 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  25.23 
 
 		 674 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  26.29 
 
 		 738 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  29.21 
 
 		 679 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0019  heat shock protein 90  27.01 
 
 		 631 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  24.47 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  26.09 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0260  heat shock protein 90  28 
 
 		 627 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.694865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  30.6 
 
 		 774 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  30.7 
 
 		 997 aa  58.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  28.23 
 
 		 640 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  27.01 
 
 		 669 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  37.62 
 
 		 364 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07530  chaperone protein HtpG  26.44 
 
 		 633 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.583875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  30.4 
 
 		 642 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  28.57 
 
 		 771 aa  54.3  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  29.1 
 
 		 774 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  27.98 
 
 		 637 aa  52  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  33.1 
 
 		 629 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1813  heat shock protein 90  26.95 
 
 		 638 aa  52  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138988  normal  0.331097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  31.47 
 
 		 606 aa  51.6  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  32.41 
 
 		 989 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0141  heat shock protein 90  26.76 
 
 		 658 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0358231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  30.77 
 
 		 971 aa  50.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  31.16 
 
 		 610 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  30.09 
 
 		 615 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  30.48 
 
 		 994 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  28.7 
 
 		 796 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  31.97 
 
 		 605 aa  49.7  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  32.32 
 
 		 684 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  28.28 
 
 		 652 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  28.08 
 
 		 610 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  27.31 
 
 		 584 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  27.34 
 
 		 667 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  26.43 
 
 		 636 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  31.41 
 
 		 619 aa  48.5  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_55230  predicted protein  29.63 
 
 		 709 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0051  heat shock protein 90  27.21 
 
 		 629 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.544882  normal  0.404377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  29.95 
 
 		 629 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  29.95 
 
 		 629 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  25.95 
 
 		 682 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  28.97 
 
 		 626 aa  48.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  23.38 
 
 		 987 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  29.93 
 
 		 628 aa  47.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  25.69 
 
 		 647 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1348  heat shock protein 90  28.85 
 
 		 618 aa  47.8  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  25.88 
 
 		 644 aa  47.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  24.65 
 
 		 665 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  24.65 
 
 		 665 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  22.77 
 
 		 756 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51649  DNA mismatch repair  33.33 
 
 		 634 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0197688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  28.69 
 
 		 783 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  33.58 
 
 		 610 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  33.93 
 
 		 665 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2338  ATP-binding region ATPase domain protein  28.33 
 
 		 638 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.268084  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  29.01 
 
 		 637 aa  46.2  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  29.48 
 
 		 638 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  24.43 
 
 		 651 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  26.2 
 
 		 630 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  26.95 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  33.33 
 
 		 634 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  28.99 
 
 		 633 aa  45.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  33.33 
 
 		 634 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  30.61 
 
 		 625 aa  45.8  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  29.55 
 
 		 722 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  30.57 
 
 		 641 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  27.44 
 
 		 657 aa  45.8  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  22.71 
 
 		 644 aa  45.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  29.82 
 
 		 723 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.06 
 
 		 589 aa  45.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0625  heat shock protein 90  30.43 
 
 		 608 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  29.83 
 
 		 635 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4309  HSP90 family protein  27.88 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  23.73 
 
 		 651 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0546  heat shock protein 90  30.43 
 
 		 608 aa  44.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325036  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  26.62 
 
 		 631 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18793  predicted protein  30.3 
 
 		 750 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  32.87 
 
 		 611 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  27.81 
 
 		 677 aa  44.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  28.74 
 
 		 642 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0856  heat shock protein 90  25.52 
 
 		 627 aa  44.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.585619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  32.58 
 
 		 629 aa  44.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  25.74 
 
 		 636 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  25.17 
 
 		 612 aa  44.3  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  28.17 
 
 		 881 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  28.98 
 
 		 635 aa  44.3  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  30.63 
 
 		 240 aa  44.3  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  28.1 
 
 		 640 aa  44.3  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0580  heat shock protein 90  28.33 
 
 		 653 aa  44.3  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.360532 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0819  ATPase domain-containing protein  26.9 
 
 		 650 aa  44.3  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>