More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2161 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
525 aa  1041    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  53.37 
 
 
1314 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  52.4 
 
 
346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  40.57 
 
 
1327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  53.31 
 
 
271 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  53.26 
 
 
1088 aa  247  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.85 
 
 
313 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.05 
 
 
1055 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  45.18 
 
 
417 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  38.58 
 
 
1225 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.98 
 
 
244 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.27 
 
 
1053 aa  234  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  54.7 
 
 
253 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.24 
 
 
1052 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  57.45 
 
 
248 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  39.49 
 
 
1215 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  39.49 
 
 
1215 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.42 
 
 
1051 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  39.49 
 
 
1215 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.12 
 
 
244 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.42 
 
 
251 aa  228  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  42.52 
 
 
391 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.63 
 
 
252 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.05 
 
 
260 aa  226  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.73 
 
 
1053 aa  225  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.16 
 
 
246 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.57 
 
 
1051 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  52.54 
 
 
263 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.54 
 
 
263 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.12 
 
 
263 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.59 
 
 
268 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.28 
 
 
254 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.16 
 
 
250 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.43 
 
 
243 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.43 
 
 
1050 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.4 
 
 
262 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.65 
 
 
1053 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.22 
 
 
257 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.45 
 
 
246 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  51.48 
 
 
262 aa  207  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.93 
 
 
238 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.14 
 
 
236 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.49 
 
 
252 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  48.62 
 
 
265 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.41 
 
 
258 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  40.95 
 
 
1186 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.15 
 
 
240 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.26 
 
 
243 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.39 
 
 
248 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.12 
 
 
252 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43599  predicted protein  39.78 
 
 
302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal  0.825443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.45 
 
 
249 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.29 
 
 
250 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2549  HAD family hydrolase  41.38 
 
 
297 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.82 
 
 
1125 aa  165  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  38.67 
 
 
294 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.4 
 
 
223 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  38.84 
 
 
219 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  39.2 
 
 
238 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  39.66 
 
 
257 aa  110  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  36.97 
 
 
253 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  35.44 
 
 
219 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  37.96 
 
 
262 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  35.8 
 
 
272 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  33.2 
 
 
214 aa  104  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  37.14 
 
 
218 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3062  trehalose-phosphatase  36.1 
 
 
323 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0840  trehalose-phosphatase  33.33 
 
 
267 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  33.94 
 
 
230 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  35.89 
 
 
209 aa  100  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  38.52 
 
 
238 aa  99.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  36.41 
 
 
261 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.88 
 
 
248 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  34.69 
 
 
219 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  34.82 
 
 
248 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5832  trehalose-phosphatase  37.96 
 
 
279 aa  97.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  32.51 
 
 
215 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03441  Trehalose-6-phosphate phosphatase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6Y289]  26.51 
 
 
908 aa  94.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.714188  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  35.89 
 
 
229 aa  94.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.15 
 
 
266 aa  93.6  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  34.15 
 
 
266 aa  93.6  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  36.4 
 
 
253 aa  93.2  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  32.64 
 
 
265 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  32.5 
 
 
264 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  34.58 
 
 
251 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  33.76 
 
 
731 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  34.13 
 
 
207 aa  91.3  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.73 
 
 
242 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  34.36 
 
 
269 aa  90.5  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  34.84 
 
 
236 aa  90.5  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  31.06 
 
 
269 aa  90.1  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.45 
 
 
245 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  34.01 
 
 
258 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  33.66 
 
 
216 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  33.92 
 
 
269 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.39 
 
 
257 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  29.26 
 
 
738 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.2 
 
 
745 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.92 
 
 
252 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  33.92 
 
 
269 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>