259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2131 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2131  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 
229 aa  458  1e-128  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1651  ribose-5-phosphate isomerase A  99.56 
 
 
229 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3987  ribose-5-phosphate isomerase A  81.5 
 
 
230 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195243  normal  0.0478731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1934  ribose-5-phosphate isomerase A  79.91 
 
 
255 aa  363  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2206  ribose-5-phosphate isomerase A  77.78 
 
 
234 aa  357  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2456  ribose-5-phosphate isomerase A  78.17 
 
 
230 aa  355  2e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485153  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2156  ribose-5-phosphate isomerase A  72.31 
 
 
243 aa  345  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2616  ribose-5-phosphate isomerase A  76 
 
 
249 aa  344  8e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2857  ribose-5-phosphate isomerase A  75.22 
 
 
240 aa  340  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2134  ribose-5-phosphate isomerase A  70.85 
 
 
219 aa  303  2e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213318  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1056  ribose-5-phosphate isomerase A  70.98 
 
 
220 aa  299  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1521  ribose-5-phosphate isomerase A  63.68 
 
 
219 aa  288  5e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414948  decreased coverage  8.20366e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1683  ribose-5-phosphate isomerase A  63.36 
 
 
235 aa  285  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187826 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1260  ribose-5-phosphate isomerase A  64.66 
 
 
235 aa  284  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1973  ribose-5-phosphate isomerase A  65.04 
 
 
231 aa  283  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1803  ribose-5-phosphate isomerase A  65.04 
 
 
231 aa  283  2e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0149  ribose-5-phosphate isomerase A  65.04 
 
 
231 aa  283  2e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689816  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1017  ribose-5-phosphate isomerase A  65.04 
 
 
231 aa  283  2e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0237346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1820  ribose-5-phosphate isomerase A  65.04 
 
 
231 aa  283  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1743  ribose-5-phosphate isomerase A  65.04 
 
 
231 aa  283  2e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548271  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1450  ribose-5-phosphate isomerase A  63.27 
 
 
230 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4691  ribose-5-phosphate isomerase A  63.72 
 
 
231 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411852  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2516  ribose-5-phosphate isomerase A  64.16 
 
 
235 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1471  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 
230 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3877  ribose-5-phosphate isomerase A  63.35 
 
 
238 aa  273  1e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  62.9 
 
 
219 aa  273  2e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1709  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 
231 aa  271  8e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729372  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2538  ribose-5-phosphate isomerase A  61.84 
 
 
231 aa  270  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal  0.356045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  63.68 
 
 
220 aa  269  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0858  ribose-5-phosphate isomerase A  62.44 
 
 
218 aa  268  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3822  ribose-5-phosphate isomerase A  62.44 
 
 
218 aa  268  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108055  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0855  ribose-5-phosphate isomerase A  62.44 
 
 
218 aa  268  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000367757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0560  ribose 5-phosphate isomerase  62.33 
 
 
220 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2088  ribose-5-phosphate isomerase A  64.29 
 
 
228 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  60.63 
 
 
219 aa  265  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  60.63 
 
 
219 aa  265  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  60.63 
 
 
219 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  60.63 
 
 
219 aa  265  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  60.63 
 
 
219 aa  265  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  60.63 
 
 
219 aa  265  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  60.63 
 
 
219 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  60.63 
 
 
219 aa  265  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  60.63 
 
 
219 aa  265  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1693  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 
231 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904452  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  60.63 
 
 
239 aa  261  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1069  ribose-5-phosphate isomerase A  63.27 
 
 
231 aa  261  7e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1525  ribose-5-phosphate isomerase A  63.27 
 
 
231 aa  261  7e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.541798 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1549  ribose-5-phosphate isomerase A  63.27 
 
 
231 aa  261  7e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  59.91 
 
 
220 aa  260  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  60.09 
 
 
231 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  59.91 
 
 
221 aa  258  5e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  60.36 
 
 
219 aa  258  5e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1168  ribose-5-phosphate isomerase A  62.5 
 
 
228 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00449603  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1232  ribose-5-phosphate isomerase A  62.5 
 
 
228 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0408833  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3560  ribose-5-phosphate isomerase A  59.29 
 
 
232 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  57.47 
 
 
218 aa  256  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0978  ribose-5-phosphate isomerase A  59.46 
 
 
219 aa  255  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0974  ribose-5-phosphate isomerase A  59.46 
 
 
219 aa  255  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2068  ribose-5-phosphate isomerase A  64.29 
 
 
228 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1012  ribose-5-phosphate isomerase A  59.46 
 
 
219 aa  255  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1526  ribose-5-phosphate isomerase A  60.63 
 
 
220 aa  255  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1150  ribose-5-phosphate isomerase A  59.01 
 
 
219 aa  255  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1076  ribose-5-phosphate isomerase A  62.05 
 
 
228 aa  254  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2667  ribose-5-phosphate isomerase A  57.01 
 
 
220 aa  254  9e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3389  ribose-5-phosphate isomerase A  58.56 
 
 
220 aa  253  1e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2542  ribose-5-phosphate isomerase A  57.92 
 
 
218 aa  253  1e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0695  ribose 5-phosphate isomerase  58.82 
 
 
220 aa  253  1e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  58.11 
 
 
218 aa  253  2e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  8.72466e-05 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  59.28 
 
 
218 aa  253  2e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  58.82 
 
 
218 aa  253  2e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1092  ribose-5-phosphate isomerase A  58.64 
 
 
219 aa  252  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.981456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  58.56 
 
 
220 aa  252  4e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  58.56 
 
 
220 aa  252  4e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  58.56 
 
 
220 aa  252  4e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0129  ribose-5-phosphate isomerase A  59.28 
 
 
219 aa  251  5e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2056  ribose-5-phosphate isomerase A  58.9 
 
 
218 aa  251  5e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000849677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  58.74 
 
 
219 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  57.66 
 
 
218 aa  250  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  58.56 
 
 
218 aa  248  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0816  ribose-5-phosphate isomerase A  56.5 
 
 
219 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1568  ribose-5-phosphate isomerase A  58.3 
 
 
220 aa  248  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.02684e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03555  ribose-5-phosphate isomerase A  57.99 
 
 
218 aa  247  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002480  ribose 5-phosphate isomerase A  58.45 
 
 
218 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00368346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1545  ribose-5-phosphate isomerase A  57.92 
 
 
218 aa  245  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3508  ribose-5-phosphate isomerase A  59.36 
 
 
218 aa  244  1e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4223  ribose-5-phosphate isomerase A  56.83 
 
 
237 aa  243  2e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2736  ribose-5-phosphate isomerase A  59.01 
 
 
219 aa  242  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1264  ribose-5-phosphate isomerase A  53.81 
 
 
236 aa  242  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.777235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0436  ribose-5-phosphate isomerase A  56.5 
 
 
219 aa  241  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4136  ribose 5-phosphate isomerase  56.19 
 
 
223 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00349227  hitchhiker  1.66181e-09 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5150  ribose-5-phosphate isomerase A  55.31 
 
 
224 aa  238  7e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.379246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5057  ribose-5-phosphate isomerase A  55.31 
 
 
224 aa  238  7e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837003  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4847  ribose-5-phosphate isomerase A  54.87 
 
 
223 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5382  ribose-5-phosphate isomerase A  55.31 
 
 
224 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5289  ribose 5-phosphate isomerase  54.42 
 
 
223 aa  235  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5203  ribose-5-phosphate isomerase A  55.11 
 
 
224 aa  235  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1176  ribose-5-phosphate isomerase A  57.34 
 
 
219 aa  235  5e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0315  ribose-5-phosphate isomerase A  54.87 
 
 
224 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03207  ribose-5-phosphate isomerase A  57.66 
 
 
220 aa  233  2e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.335569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  57.62 
 
 
215 aa  231  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>