More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2094 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  98.43 
 
 		 319 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  71.25 
 
 		 319 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  73.4 
 
 		 310 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  59.11 
 
 		 303 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  59.42 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  57.59 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  58.15 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  58.54 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  58.47 
 
 		 303 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  57.51 
 
 		 305 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  57.28 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  58.79 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  56.87 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  56.87 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  55.59 
 
 		 302 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  56.23 
 
 		 303 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  53.67 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  56.6 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  59.26 
 
 		 305 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  47.68 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  48.57 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  48.55 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  45.57 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  45.28 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  44.03 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  46.47 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  45.86 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  46.47 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  46.01 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  46.56 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  42.28 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  41.38 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  44.04 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  36.81 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  37.25 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.09 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  36.66 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  39.93 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  34.19 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  34.62 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  25.48 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  34.52 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  34.52 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  27.94 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  31.9 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  31.31 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  30.04 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  29.73 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  32.4 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  37.33 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  30.23 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.33 
 
 		 807 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  27.59 
 
 		 409 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  33.67 
 
 		 390 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  35.23 
 
 		 400 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  42.47 
 
 		 318 aa  95.9  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  29.56 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  27.1 
 
 		 395 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  28.31 
 
 		 384 aa  93.2  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  27.05 
 
 		 353 aa  93.2  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.04 
 
 		 768 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  29.68 
 
 		 393 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.42 
 
 		 776 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  33.91 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  35.2 
 
 		 402 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  29.29 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  33.47 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  31.76 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  30.07 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  25.95 
 
 		 390 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.7 
 
 		 479 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  27.13 
 
 		 391 aa  89.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  29.69 
 
 		 390 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  29.69 
 
 		 390 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  27.97 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  28.88 
 
 		 395 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.1 
 
 		 711 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  29.3 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  28.91 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  30.45 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  23.4 
 
 		 389 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  25.4 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  31.02 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  28.24 
 
 		 415 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.95 
 
 		 713 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  27.49 
 
 		 394 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  33.86 
 
 		 380 aa  86.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  34.52 
 
 		 396 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  34.24 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.95 
 
 		 713 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.1 
 
 		 709 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  28.69 
 
 		 393 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.1 
 
 		 709 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  28.29 
 
 		 396 aa  85.9  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  25.58 
 
 		 411 aa  85.9  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>