More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1992 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  99.68 
 
 
317 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  72.9 
 
 
330 aa  488  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  77.43 
 
 
319 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  68.55 
 
 
322 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  61.37 
 
 
321 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  61.8 
 
 
351 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  63.88 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  61.25 
 
 
320 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  63.55 
 
 
322 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  60.31 
 
 
320 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.99 
 
 
330 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.99 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  48.32 
 
 
339 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.55 
 
 
327 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.1 
 
 
334 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.19 
 
 
335 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.75 
 
 
345 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.37 
 
 
328 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.75 
 
 
345 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.31 
 
 
327 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.37 
 
 
336 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.3 
 
 
327 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.87 
 
 
318 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.3 
 
 
325 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.3 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.18 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.18 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.84 
 
 
328 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.97 
 
 
338 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  44.97 
 
 
341 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.03 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.63 
 
 
328 aa  265  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  44.63 
 
 
322 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.3 
 
 
328 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.65 
 
 
333 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.82 
 
 
328 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.76 
 
 
326 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.14 
 
 
334 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  44.44 
 
 
321 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.42 
 
 
349 aa  261  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  44.73 
 
 
322 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.12 
 
 
332 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.32 
 
 
334 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.12 
 
 
318 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.62 
 
 
339 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.06 
 
 
356 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  43.38 
 
 
325 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.38 
 
 
335 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.44 
 
 
360 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.56 
 
 
328 aa  257  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  48.44 
 
 
330 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  45.83 
 
 
338 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  44.97 
 
 
327 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.14 
 
 
325 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  45.39 
 
 
361 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.82 
 
 
324 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.58 
 
 
327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.47 
 
 
336 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.48 
 
 
328 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.82 
 
 
358 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.1 
 
 
331 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  43.12 
 
 
330 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.8 
 
 
328 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.46 
 
 
325 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.3 
 
 
330 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.47 
 
 
329 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.38 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  43.84 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  40.5 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.47 
 
 
346 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.24 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  46.49 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  44.11 
 
 
331 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.12 
 
 
328 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.15 
 
 
331 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.14 
 
 
335 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.07 
 
 
325 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.11 
 
 
332 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  44.63 
 
 
328 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  43.29 
 
 
327 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  43.05 
 
 
325 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  43.12 
 
 
332 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.39 
 
 
304 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  46.39 
 
 
335 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  42.14 
 
 
336 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.26 
 
 
344 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.89 
 
 
333 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.67 
 
 
355 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.14 
 
 
321 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  43.39 
 
 
332 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  42.67 
 
 
327 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.49 
 
 
329 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  43.91 
 
 
329 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.33 
 
 
325 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  43.39 
 
 
314 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  43.55 
 
 
322 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  43.92 
 
 
335 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.19 
 
 
323 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>