141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1949 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  99.07 
 
 
322 aa  634    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  88.54 
 
 
323 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  88.14 
 
 
344 aa  528  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  79.18 
 
 
325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  78.23 
 
 
325 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  74.12 
 
 
322 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  72.78 
 
 
326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  75 
 
 
323 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  72.78 
 
 
326 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  74.58 
 
 
329 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  74.41 
 
 
323 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  69.94 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  69.94 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  69.94 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  69.94 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  69.94 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  69.63 
 
 
323 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  74.58 
 
 
321 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  74.58 
 
 
321 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  69.63 
 
 
323 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  74.58 
 
 
321 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  74.58 
 
 
321 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  73.56 
 
 
321 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  70.19 
 
 
323 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  68.47 
 
 
324 aa  418  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  61.36 
 
 
343 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  57.24 
 
 
341 aa  347  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  57.24 
 
 
341 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  52.87 
 
 
324 aa  338  7e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  53.21 
 
 
317 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  54.78 
 
 
319 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  55.41 
 
 
317 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  52.63 
 
 
370 aa  324  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  54.36 
 
 
323 aa  322  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  53.33 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  52.38 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  54.18 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  56.21 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  55.86 
 
 
321 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  51.17 
 
 
349 aa  316  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  52.33 
 
 
317 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  48.98 
 
 
321 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  47.3 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  48.98 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.95 
 
 
327 aa  273  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  46.58 
 
 
325 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  42.95 
 
 
329 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  45.77 
 
 
337 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  44.6 
 
 
341 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  43.05 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  41.28 
 
 
329 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  42.11 
 
 
324 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  41.67 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40 
 
 
584 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  43.31 
 
 
335 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  39.59 
 
 
338 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  40.06 
 
 
340 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  41.08 
 
 
320 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  42.96 
 
 
330 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  41.95 
 
 
336 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  39.06 
 
 
332 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  43.25 
 
 
270 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  38.38 
 
 
332 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  37.19 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  35.03 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  39.5 
 
 
319 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.34 
 
 
320 aa  186  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  37.37 
 
 
331 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  37.8 
 
 
328 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.38 
 
 
347 aa  176  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  36.26 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  36.72 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  32.29 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  36.9 
 
 
329 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  36.36 
 
 
640 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  33.1 
 
 
328 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  32.76 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  30.39 
 
 
329 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  32.86 
 
 
298 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.56 
 
 
359 aa  158  9e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  30.21 
 
 
334 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.62 
 
 
344 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  31.27 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  35.03 
 
 
322 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  29.51 
 
 
327 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.86 
 
 
352 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  32.79 
 
 
384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  30.47 
 
 
355 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  29.45 
 
 
322 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  26.73 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  25.47 
 
 
320 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  28.44 
 
 
329 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  28.62 
 
 
354 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  27.85 
 
 
324 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  25.74 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  30.93 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  25.4 
 
 
326 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  26.48 
 
 
344 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  27.09 
 
 
365 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>