85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1940 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1940  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 164 aa  326  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0344722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1743  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  99.39 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1870  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  73.62 
 
 		 164 aa  253  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0449  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  74.85 
 
 		 164 aa  248  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3296  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  70.73 
 
 		 164 aa  236  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3955  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  76.07 
 
 		 178 aa  220  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.948597  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0089  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  40.24 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3117  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.72 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.573948  hitchhiker  0.000638451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4881  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.71 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4716  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.17 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.60201  normal  0.0226509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07670  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  30.83 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3144  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.57 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.36824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3569  hypothetical protein  28.95 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2559  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.85 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000186717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1267  aspartate kinase, monofunctional class  30.16 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457772  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5096  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.76 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000630  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component  27.61 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2410  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.7 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.932493  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0195  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.47 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224778  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5667  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  30.17 
 
 		 622 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4095  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  29.01 
 
 		 628 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0208  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.46 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3481  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.03 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117501  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2444  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.07 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3587  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.92 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.677998  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1289  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.17 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4629  C4-dicarboxylate transporter  28.43 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2756  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.43 
 
 		 628 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.95761  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1318  C4-dicarboxylate transport system, small subunit  23.68 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000464953  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0492  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.9 
 
 		 634 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.189133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1539  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.75 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0554  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.59 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.29193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1794  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.45 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52820  C4-dicarboxylate transporter  27.45 
 
 		 212 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1376  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2862  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.83 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.779712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5907  dicarboxylate transporter  28.77 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4704  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.36 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0485  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  26.96 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.598438  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2137  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.96 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103028  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68280  dicarboxylate transporter  28.77 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.408841  normal  0.10811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2977  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.39 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329159  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4092  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.85 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499769  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3359  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  37.88 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3002  TRAP transporter - DctQ subunit  24.11 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0520  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.77 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  34.12 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0610  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.6 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1723  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.68 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0475394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0596  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.6 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000617065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0369  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.28 
 
 		 624 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4819  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.97 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579916 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3687  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.91 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2754  tripartite ATP-independent periplasmic transporter  33.96 
 
 		 196 aa  44.3  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.03848 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1773  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.89 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3318  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.12 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00300706  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3965  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.55 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5743  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component (dctQ subunit)  25.35 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.991204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1274  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  29.21 
 
 		 635 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0864144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2517  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.19 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.514698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0544  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.6 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.557919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0933  ribosomal protein S3  25.74 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0261181  hitchhiker  0.0059553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0034  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  28.1 
 
 		 627 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.15 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2238  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 		 167 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3744  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.77 
 
 		 155 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0785  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.58 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5222  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.42 
 
 		 634 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0408  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.31 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4769  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.55 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03640  TRAP dicarboxylic acid transporter, small integral-membrane component, DctQ  29.09 
 
 		 210 aa  41.6  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.55 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1470  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6142  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  26.21 
 
 		 619 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4296  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.64 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3521  trap-type c4-dicarboxylate transport system, small permease  23.24 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.524477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0023  permease (transport protein)  22.6 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.352968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004049  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component  23.21 
 
 		 224 aa  40.8  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0353  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.89 
 
 		 197 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0563377  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3351  tripartite ATP-independent periplasmic  23.24 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3420  tripartite ATP-independent periplasmic  23.24 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.336165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3051  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.14 
 
 		 210 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4195  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.2 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293358  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0619  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.47 
 
 		 182 aa  40.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355022  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4747  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.69 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331023  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>