More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1834 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 383 aa  739    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  98.43 
 
 		 383 aa  730    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  69.11 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  69.11 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  69.11 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  68.32 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  69.11 
 
 		 383 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  68.85 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.37 
 
 		 384 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  58.73 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  60.37 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.02 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  54.91 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  50.77 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.66 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  51.67 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.72 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  50.81 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  47.19 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  44.67 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  49.6 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  46.01 
 
 		 398 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.35 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  29.33 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 389 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  28.39 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.52 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  31.29 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  32.42 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  29.44 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  29.08 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 438 aa  90.5  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  27.88 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 		 411 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  27.88 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.58 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  30.14 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  25.81 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  25.81 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.86 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  25.81 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  25.81 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  25.81 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  25.81 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  28 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  28 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  30.47 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  25.81 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  27.91 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  25.81 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  24.48 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.46 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  24.48 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  28.83 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  26.3 
 
 		 569 aa  79.7  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  28.27 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  24.59 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2688  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000261317  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  24.59 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  25.78 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  26.12 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  24.59 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.21 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  25.71 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  34.23 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.26 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3894  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.45 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.86 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  22.19 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.51 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.36 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  26.25 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.41 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  24.86 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.87 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  24.87 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  24.17 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  24.86 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>