183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1816 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  98.61 
 
 		 288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  42.2 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  40.78 
 
 		 312 aa  201  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  41.7 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  37.85 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  37.85 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  37.85 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  41.05 
 
 		 284 aa  191  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  39.08 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  36.04 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  40.34 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  42.46 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  39.72 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  36.4 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  41.75 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  37.46 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  33.69 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  37.81 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  35.34 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  30.58 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  30.03 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  33.69 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  26.92 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  26.22 
 
 		 284 aa  99  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  22.11 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  21.83 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  20.95 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  42.55 
 
 		 126 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  22.73 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  32.61 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  27.89 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  31.33 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  31.72 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  28.64 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  28.84 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.1 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  32.26 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  29.96 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  28.02 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  25.26 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  25.41 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  25.6 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  31.33 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  30.11 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  24.41 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  31.18 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.85 
 
 		 138 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  32.58 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  33.11 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.62 
 
 		 164 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  33.05 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  31.77 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  29.3 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  32.26 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  27.32 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  27.06 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  35.82 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  32.45 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  31.75 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  30.61 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  26.94 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  30.61 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  30.61 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  30.61 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  32.1 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  35.26 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  25.58 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  32.86 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  26.95 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  31.34 
 
 		 157 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  33.58 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  27.1 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.92 
 
 		 162 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.92 
 
 		 162 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  28.7 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  27.81 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  28.42 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 		 128 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  28.29 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  28.29 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  29.03 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>