More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1717 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  99.08 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  69.34 
 
 		 215 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  69.67 
 
 		 221 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  72.99 
 
 		 228 aa  286  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  63.84 
 
 		 225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  63.84 
 
 		 260 aa  277  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  66.98 
 
 		 226 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  64.76 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  64.49 
 
 		 220 aa  247  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  64.59 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  55.87 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  54.72 
 
 		 206 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  54.72 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  54.85 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  54.46 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  54.46 
 
 		 206 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  54.46 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  53.52 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  53.52 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  53.52 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  53.52 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  53.52 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  54.5 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  53.99 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  53.99 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  53.85 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  53.99 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  53.99 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  53.99 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  53.99 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  53.99 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  51.66 
 
 		 205 aa  204  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  53.85 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  52.4 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  48.54 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  47.8 
 
 		 214 aa  188  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 210 aa  187  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  51.96 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  51.49 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  54.31 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  51.47 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50.98 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  46.4 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.44 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  48.61 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  42.73 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  46.41 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.43 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  45.5 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.92 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.93 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.52 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  47.91 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.8 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  45.64 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 901 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.31 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 209 aa  152  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  46.3 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  37.63 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  37.33 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  46.01 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.34 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  43.14 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  35.38 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  37.32 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  39.55 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  41.43 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  45.23 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>