More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1692 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
452 aa  881    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  98.23 
 
 
452 aa  866    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.58 
 
 
422 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28.85 
 
 
412 aa  143  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 
433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  29.67 
 
 
411 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  30.16 
 
 
435 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 
405 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
405 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  29.68 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.76 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  29.75 
 
 
408 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  30.08 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  28.43 
 
 
411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  26.53 
 
 
406 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
411 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  30.05 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  31.58 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
407 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  29.27 
 
 
436 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  27.29 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  28.54 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.33 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  27.27 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.64 
 
 
407 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  26.65 
 
 
457 aa  126  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  30.41 
 
 
418 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  29.48 
 
 
417 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.54 
 
 
429 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
405 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  27.36 
 
 
413 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  28.24 
 
 
427 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  30.33 
 
 
435 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.47 
 
 
430 aa  124  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.42 
 
 
417 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  27.36 
 
 
412 aa  124  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
432 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
432 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29.29 
 
 
442 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  30.87 
 
 
406 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  30.87 
 
 
400 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  24.94 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  26.59 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  24.94 
 
 
404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  28.57 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  25.97 
 
 
404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  31.05 
 
 
409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
409 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.23 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  28.98 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  27.59 
 
 
406 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  29.47 
 
 
427 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
405 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.32 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  28.16 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.1 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  27.4 
 
 
436 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  29.89 
 
 
427 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
433 aa  116  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  30.43 
 
 
480 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  26.92 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  27.87 
 
 
412 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  30.02 
 
 
433 aa  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  27.87 
 
 
412 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
408 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  30.28 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  29.84 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  26.76 
 
 
403 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  29.58 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  26.33 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  29.53 
 
 
432 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
409 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  28.95 
 
 
402 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  27.73 
 
 
421 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  26.49 
 
 
410 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  26.65 
 
 
427 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  30.15 
 
 
401 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  28.17 
 
 
416 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  27.36 
 
 
410 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  29.29 
 
 
399 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
416 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
405 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  29.22 
 
 
428 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  28.34 
 
 
410 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  29.47 
 
 
399 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  27.08 
 
 
414 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  28.07 
 
 
410 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
405 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  26.96 
 
 
427 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>