More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1655 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  98.53 
 
 		 273 aa  550  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  74.72 
 
 		 269 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  74.17 
 
 		 272 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  73.78 
 
 		 269 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  69.63 
 
 		 268 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  69.06 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  63.33 
 
 		 270 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  60.37 
 
 		 268 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  50.91 
 
 		 274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  51.09 
 
 		 274 aa  244  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  49.43 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  48.54 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 		 277 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  50.74 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  48.18 
 
 		 274 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  48.72 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  41.42 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  39.55 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  43.55 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  36.78 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 258 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  24.91 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  36.57 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.24 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  29.76 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.57 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.57 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  45.92 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  31.88 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.84 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  33.08 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 300 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.69 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  28.47 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  32.33 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.77 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  35.63 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  35.88 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.39 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.39 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  22.14 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.39 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  27.37 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  27.78 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.62 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.4 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.09 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.74 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  27.74 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>