42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1553 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  40 
 
 
144 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  40.3 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  35.29 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  35.29 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  27.54 
 
 
214 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  33.78 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  22.92 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  30.53 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  27.66 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  36.62 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  31.25 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  36.36 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.24 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  32.26 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  32.1 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  32 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.06 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  39.06 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  30.95 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  36.51 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  33.33 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  34.92 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  33.9 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  31.4 
 
 
193 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  25.17 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  32.79 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1243  putative phage repressor  20 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  21.76 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.94 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  32 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  30.93 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  38.1 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  17.86 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  29.51 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  23.17 
 
 
205 aa  43.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  32.94 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  29.33 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  32.79 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  31.25 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  21.69 
 
 
233 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 
210 aa  42  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>