30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1551 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1551  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal  0.0855626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2305  hypothetical protein  40.95 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.059847  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2596  hypothetical protein  43.09 
 
 
212 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2469  transcriptional activator FlhC  27.13 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000243511  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2085  transcriptional activator FlhC  28.19 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  unclonable  1.9119800000000002e-30 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2140  transcriptional activator FlhC  28.19 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000606763  unclonable  4.37238e-33 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2080  transcriptional activator FlhC  28.19 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000348809  decreased coverage  0.000000427944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1320  transcriptional activator FlhC  28.19 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000170782  decreased coverage  3.16651e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1197  transcriptional activator FlhC  28.19 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000725096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1537  transcriptional activator FlhC  26.13 
 
 
193 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00505633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2614  transcriptional activator FlhC  25.13 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00253226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1852  transcriptional activator FlhC  25.13 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00303286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2988  transcriptional activator FlhC  26.06 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.996074  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2630  transcriptional activator FlhC  26.6 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574971  hitchhiker  0.00000000000000252047 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01851  hypothetical protein  26.6 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1749  flagellar transcriptional activator FlhC  26.6 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0010889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1293  transcriptional activator FlhC  26.6 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169598  decreased coverage  0.00000000643464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1741  transcriptional activator FlhC  26.6 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0165294  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2124  transcriptional activator FlhC  26.6 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1987  transcriptional activator FlhC  26.6 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.76515e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01862  DNA-binding transcriptional dual regulator with FlhD  26.6 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1509  transcriptional activator FlhC  25.63 
 
 
193 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1746  transcriptional activator FlhC  24.47 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0285133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2828  transcriptional activator FlhC  24.47 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.896051  normal  0.0881752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1635  transcriptional activator FlhC  24.47 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3686  transcriptional activator FlhC  26.49 
 
 
201 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5565  hypothetical protein  27.91 
 
 
401 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.753829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5605  transcriptional activator FlhC  27.03 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.31133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4159  transcriptional activator FlhC  24.22 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1241  transcriptional activator FlhC  27.22 
 
 
184 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>