More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1523 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  52.69 
 
 		 755 aa  712    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 727 aa  1481    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  46.21 
 
 		 724 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  45.91 
 
 		 705 aa  571  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  46.81 
 
 		 724 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  43.08 
 
 		 771 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  44.23 
 
 		 719 aa  538  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 		 755 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  40.88 
 
 		 756 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  41.97 
 
 		 735 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 707 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  35.73 
 
 		 792 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 693 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  36.3 
 
 		 719 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 		 707 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 694 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 715 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 770 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 710 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 710 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 706 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 706 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 757 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 709 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  32.51 
 
 		 695 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 708 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 		 747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 747 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 745 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 769 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  32.21 
 
 		 753 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 732 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 732 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 740 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 		 741 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.75 
 
 		 711 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 759 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 734 aa  301  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 710 aa  300  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 711 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  30.57 
 
 		 709 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 759 aa  296  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 708 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 766 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 689 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 698 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 748 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  32.14 
 
 		 748 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  32.37 
 
 		 772 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 826 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  31.03 
 
 		 680 aa  291  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 821 aa  291  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 748 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 736 aa  290  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 747 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 700 aa  290  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 748 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 747 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 747 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 734 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 747 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 747 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 742 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 742 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  32.07 
 
 		 731 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 753 aa  283  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 860 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 749 aa  277  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 722 aa  275  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 724 aa  274  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 		 733 aa  274  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 739 aa  273  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 751 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 710 aa  270  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 733 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  31.61 
 
 		 765 aa  269  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 733 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 769 aa  266  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 753 aa  266  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 741 aa  264  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 780 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 776 aa  261  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 757 aa  260  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 760 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 726 aa  259  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 768 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.9 
 
 		 703 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.51 
 
 		 708 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  28.61 
 
 		 760 aa  258  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 712 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  28.61 
 
 		 760 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 726 aa  257  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 764 aa  257  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  28.61 
 
 		 760 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 760 aa  256  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  28.61 
 
 		 760 aa  256  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  28.3 
 
 		 760 aa  256  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  28.61 
 
 		 760 aa  256  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.09 
 
 		 696 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>