More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1505 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
387 aa  756    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  81.77 
 
 
391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.61 
 
 
396 aa  349  6e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  50.38 
 
 
396 aa  346  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  51.65 
 
 
383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  48.98 
 
 
383 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  50.9 
 
 
403 aa  338  7e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.15 
 
 
398 aa  338  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  51.3 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  49.01 
 
 
407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  48.64 
 
 
407 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  48.4 
 
 
403 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  49.24 
 
 
404 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  49.24 
 
 
404 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  48.64 
 
 
402 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  48.64 
 
 
402 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  48.64 
 
 
402 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  48.64 
 
 
402 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  48.64 
 
 
402 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.72 
 
 
398 aa  328  8e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  47.9 
 
 
401 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.9 
 
 
401 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.26 
 
 
380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  47.77 
 
 
402 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  46.62 
 
 
392 aa  326  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.9 
 
 
401 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  47.9 
 
 
401 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.9 
 
 
401 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.65 
 
 
401 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  51.4 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  51.4 
 
 
387 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  51.12 
 
 
388 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.96 
 
 
388 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.23 
 
 
379 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.95 
 
 
390 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  46.94 
 
 
386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.74 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.31 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49 
 
 
412 aa  302  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  48.48 
 
 
383 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  49.23 
 
 
379 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  49.48 
 
 
386 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.71 
 
 
408 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.42 
 
 
385 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  48.29 
 
 
385 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  53.02 
 
 
385 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.25 
 
 
417 aa  293  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  48.41 
 
 
443 aa  292  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  45.85 
 
 
386 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  48.8 
 
 
380 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  47.13 
 
 
386 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  46.55 
 
 
386 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  48.02 
 
 
389 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  45.27 
 
 
402 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  45.27 
 
 
386 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  48.02 
 
 
389 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  44.13 
 
 
442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  45.69 
 
 
386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.22 
 
 
442 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.13 
 
 
513 aa  276  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  47.15 
 
 
372 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  49.45 
 
 
383 aa  272  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  51.09 
 
 
511 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  41.28 
 
 
468 aa  260  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  41.07 
 
 
467 aa  259  4e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  43.41 
 
 
505 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39.65 
 
 
502 aa  259  7e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  38.22 
 
 
472 aa  256  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  44.31 
 
 
502 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  43.15 
 
 
506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.78 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  47.56 
 
 
384 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  41.43 
 
 
350 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  39.57 
 
 
471 aa  249  7e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  46.47 
 
 
461 aa  248  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  42.43 
 
 
498 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  40.19 
 
 
471 aa  248  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  44.41 
 
 
496 aa  246  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  41.88 
 
 
472 aa  245  9e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  41.88 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.18 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  42.28 
 
 
494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  43.19 
 
 
472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  44.59 
 
 
393 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  40.75 
 
 
453 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  43.8 
 
 
463 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  44.44 
 
 
450 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  47.62 
 
 
451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.58 
 
 
467 aa  240  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  43.33 
 
 
488 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  44.25 
 
 
488 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  47.25 
 
 
449 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  44.12 
 
 
468 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  43.21 
 
 
472 aa  238  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  44.92 
 
 
465 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  42.29 
 
 
504 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  43.77 
 
 
499 aa  237  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  46.47 
 
 
450 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  42.53 
 
 
482 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  45.09 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>