56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1110 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  714    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  42.02 
 
 		 367 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  44.72 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  29.27 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  28.78 
 
 		 367 aa  86.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  32.21 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  43.75 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  36.89 
 
 		 691 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  33.93 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  27.55 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  26.94 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  26.14 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  30.73 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  35.76 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  25.82 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  30.94 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  39.01 
 
 		 609 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  29.71 
 
 		 650 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  32.56 
 
 		 632 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  26.97 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  27.41 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  29.61 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  35.34 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  27.91 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  34.93 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1312  hypothetical protein  43.97 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  36.84 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  32.41 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  26.64 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  23.02 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.09 
 
 		 719 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  27.63 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  31.97 
 
 		 717 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  31.97 
 
 		 717 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  31.97 
 
 		 717 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  31.97 
 
 		 717 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  31.97 
 
 		 717 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  30.2 
 
 		 721 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.12 
 
 		 651 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  28.12 
 
 		 651 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  30.61 
 
 		 717 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  30.61 
 
 		 720 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.75 
 
 		 746 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  30.61 
 
 		 720 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  30.61 
 
 		 720 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  30.61 
 
 		 720 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  30.61 
 
 		 720 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  30.61 
 
 		 717 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  30.61 
 
 		 720 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  30.61 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  31.54 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  26.67 
 
 		 638 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.3 
 
 		 746 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  29.08 
 
 		 733 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  34.58 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  26.47 
 
 		 600 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>