More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1101 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  99.23 
 
 
260 aa  510  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  68.22 
 
 
255 aa  342  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  66.93 
 
 
254 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2780  ABC transporter related  68.22 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.138295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  67.06 
 
 
266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2794  ABC transporter related  64.17 
 
 
267 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2552  ABC transporter related  62.11 
 
 
260 aa  284  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  48.84 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2305  ferric-citrate ABC transporter ATPase  47.06 
 
 
276 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.891449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  42.21 
 
 
259 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.32 
 
 
266 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.81 
 
 
266 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  44.73 
 
 
260 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  40.24 
 
 
294 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 
260 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
490 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  41.8 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  42.55 
 
 
260 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  41.35 
 
 
271 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  38.68 
 
 
264 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  36.86 
 
 
273 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  41.15 
 
 
267 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  40.33 
 
 
271 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.82 
 
 
258 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
256 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 
256 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
536 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
273 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
273 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
273 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  33.06 
 
 
255 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
273 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  33.33 
 
 
256 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
273 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
273 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  39.33 
 
 
259 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  42.29 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 
256 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  39.76 
 
 
255 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  37.6 
 
 
266 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4289  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 
256 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0514  iron ABC transporter ATP-binding protein  40.48 
 
 
267 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275192  normal  0.0986315 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 
265 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 
256 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
256 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.12 
 
 
339 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  39.17 
 
 
260 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.96 
 
 
255 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.95 
 
 
256 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.95 
 
 
256 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  31.78 
 
 
254 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  40.59 
 
 
260 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  37.96 
 
 
266 aa  148  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  40.36 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.14 
 
 
414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  42.16 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.76 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  37.72 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  37.9 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  38.1 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2394  ABC transporter related  31.3 
 
 
252 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0360608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
258 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  39.37 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  35.63 
 
 
419 aa  145  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  35.04 
 
 
265 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  33.73 
 
 
267 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  35.04 
 
 
265 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  36.26 
 
 
278 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  39.53 
 
 
282 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  41.44 
 
 
252 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  43.44 
 
 
260 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0371  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATPase component  34.68 
 
 
242 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.140536  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  40.71 
 
 
287 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  40.69 
 
 
271 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  31.91 
 
 
405 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
285 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  37.87 
 
 
271 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 
270 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.64 
 
 
259 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  38.03 
 
 
265 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  41 
 
 
259 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  41.13 
 
 
270 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  34.85 
 
 
251 aa  141  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  35.47 
 
 
271 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  38.29 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  30.45 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>