83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1093 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1093  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  455  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  98.74 
 
 		 239 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2784  hypothetical protein  54.55 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1160  hypothetical protein  58.82 
 
 		 197 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1532  hypothetical protein  49.03 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3773  hypothetical protein  44.3 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1939  hypothetical protein  43.22 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1209  hypothetical protein  47.39 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2825  hypothetical protein  43.1 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00604868  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  37.32 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2469  putative transmembrane protein  39.04 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  36.84 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  30.6 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  30.6 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  31.9 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  30.6 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  30.73 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  31.87 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  32.46 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  31.92 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  31.9 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  31.9 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  30.54 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2770  putative transmembrane protein  34.03 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  30.54 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  32.39 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  32.47 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  30.32 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  31.96 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  31.91 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  30.53 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  30.96 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  31.32 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  30.53 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  33.68 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  30.15 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  29.17 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  28.03 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  31.28 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  29.95 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  30.81 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  32.26 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  32.3 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  33.15 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  33.68 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  30.56 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  28.21 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  29.26 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  30.27 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  32.62 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  30.1 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  29 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  29.63 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  31.05 
 
 		 288 aa  51.6  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  30.53 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3557  hypothetical protein  32.6 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0172503  normal  0.774445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  31.02 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  28.02 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  27.63 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  38.03 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  26.72 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2033  transmembrane protein  30.23 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  24.74 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  25.7 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  30.81 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  29.8 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  27.72 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2036  hypothetical protein  30.46 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  32.82 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  32.82 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  27.68 
 
 		 409 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  20.6 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  57.5 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  30.89 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  35.09 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1814  hypothetical protein  29.73 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  26.74 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  27.87 
 
 		 228 aa  42  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  27.03 
 
 		 226 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  23.12 
 
 		 621 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3376  hypothetical protein  27.72 
 
 		 257 aa  42  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>