More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1058 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1058  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
258 aa  520  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0976  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
258 aa  520  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.08 
 
 
239 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.1 
 
 
239 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.58 
 
 
239 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.72 
 
 
239 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
239 aa  224  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.29 
 
 
241 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
241 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  47.95 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  46.19 
 
 
239 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.02 
 
 
234 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 
228 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
227 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
243 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
243 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 
228 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
235 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
235 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
235 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0259  cyclic nucleotide-binding protein  31.08 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0213  cyclic nucleotide-binding protein  29.96 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.04 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  33.04 
 
 
239 aa  95.9  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4309  cyclic nucleotide-binding  31.58 
 
 
232 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.05 
 
 
234 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
228 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0775  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
237 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.73 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3129  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.28 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4311  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.342841 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  30.49 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
235 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3433  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00135571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6768  cyclic nucleotide-binding protein  29.8 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1395  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.49 
 
 
304 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.553188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0137  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.49 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  30.24 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.49 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1475  cyclic nucleotide-binding protein  29.49 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.24 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5005  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62031  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
224 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
233 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 
225 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3223  cyclic nucleotide-binding protein  30.05 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.319468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
235 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4072  cyclic nucleotide-binding protein  29.58 
 
 
247 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4294  cyclic nucleotide-binding protein  29.58 
 
 
247 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.803161  normal  0.987027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1379  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3712  cyclic nucleotide-binding protein  28.64 
 
 
259 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.91 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4190  cyclic nucleotide-binding protein  28.64 
 
 
262 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1075  cyclic nucleotide-binding protein  29.44 
 
 
281 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.24 
 
 
254 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0464  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.8 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0498511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  28.94 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  28.94 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2305  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.44 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  28.94 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  28.94 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0992  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.44 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0799157  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  28.94 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  27.68 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5767  putative HTH Crp family transcriptional regulator  29.55 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1687  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  28.31 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4116  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0018  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0473  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.05 
 
 
248 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.778441  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
226 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1725  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.91 
 
 
251 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134143  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0605  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
252 aa  82  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2580  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3605  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.391558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3543  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6158  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.7 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0023  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.19 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.19 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1160  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>