More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1054 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  588  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  99.02 
 
 		 306 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  70.43 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  46.26 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.33 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.99 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  48.84 
 
 		 308 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  48.93 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  48.21 
 
 		 293 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  47.78 
 
 		 297 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  48.21 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.61 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  48.21 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  47.9 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  47.2 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  47.2 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  47.2 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  47.2 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  47.2 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  47.2 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  46.07 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  46.44 
 
 		 293 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  46.94 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  49.14 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  43.33 
 
 		 326 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  45 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  44.37 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  45 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  42.19 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  41.2 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  43.24 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  43.69 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  40.34 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.68 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  40.68 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  40.34 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  40.68 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  40.68 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  44.98 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  40.68 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  41.69 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  42.42 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  42.71 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  43.45 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  43.45 
 
 		 299 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  43.45 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  43.45 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  43.45 
 
 		 299 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  39.11 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  38.75 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  41.67 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  44.09 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.43 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  41.87 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  34.87 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.91 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.96 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  41.26 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.71 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.41 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  40.72 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  43.65 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  40 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  38.95 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  41.55 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  35.09 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  36.52 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  35.82 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  37.1 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  32.89 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  37.23 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.85 
 
 		 300 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  38.11 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  38.65 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  35.45 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  30.55 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  44.02 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  31.21 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  35.88 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  39.6 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  32.86 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  30.14 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  33.58 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  31.21 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  32.27 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  28.91 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  31.5 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  27.07 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  28.28 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.33 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  27.18 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  27.56 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.92 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  27.3 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  26.6 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>