More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1028 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  98.05 
 
 		 715 aa  1334    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 718 aa  1438    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 817 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 792 aa  251  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 710 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 837 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 829 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 757 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 709 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 713 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  31.57 
 
 		 695 aa  230  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 730 aa  230  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 850 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 710 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 770 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 815 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 		 706 aa  227  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 710 aa  227  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 		 706 aa  227  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 779 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 709 aa  226  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 821 aa  224  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 860 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 726 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 799 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 722 aa  221  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 726 aa  221  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 717 aa  221  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 864 aa  220  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 698 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 689 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 717 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 743 aa  218  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 776 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 819 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 700 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 701 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 791 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 701 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 701 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 831 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 701 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 723 aa  212  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 757 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  28.71 
 
 		 791 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  29.42 
 
 		 716 aa  211  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 862 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 757 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 748 aa  210  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.04 
 
 		 703 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 828 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 701 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  28.76 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 692 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.25 
 
 		 708 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1372  TonB-dependent receptor, plug  55.45 
 
 		 249 aa  209  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521856  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 689 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 		 778 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 828 aa  208  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 726 aa  207  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 829 aa  207  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 719 aa  207  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 689 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 738 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 701 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 751 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 707 aa  205  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 734 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 859 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 767 aa  204  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 797 aa  204  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 825 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 705 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 828 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 771 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 703 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 825 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  28.59 
 
 		 728 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 721 aa  201  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 843 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 820 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 724 aa  201  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 743 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 717 aa  200  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 828 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 719 aa  200  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  29.79 
 
 		 680 aa  200  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 711 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 722 aa  200  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 694 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 708 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 796 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 742 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 696 aa  198  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 742 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 689 aa  197  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 719 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 712 aa  196  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  29.41 
 
 		 689 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 743 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>