23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0702 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  99.65 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  71.22 
 
 		 288 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  63.76 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  64.66 
 
 		 287 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  61.05 
 
 		 293 aa  358  8e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  46.37 
 
 		 290 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  37.1 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  39.53 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  33.44 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  25.71 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  30.33 
 
 		 345 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  32.09 
 
 		 345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  30.1 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  30.68 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  28.81 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  24.23 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  30.87 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  28.64 
 
 		 199 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.33 
 
 		 208 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  28.87 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  24.54 
 
 		 192 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>