More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0542 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
983 aa  2011    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  40.11 
 
 
1152 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
1067 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
1152 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 
1509 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  38.56 
 
 
958 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  42.83 
 
 
1275 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
765 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  41.7 
 
 
988 aa  386  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  42.36 
 
 
710 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  40.6 
 
 
733 aa  382  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
746 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  40.14 
 
 
1182 aa  379  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
625 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
625 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  39.7 
 
 
632 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 
723 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.65 
 
 
1561 aa  370  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
625 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  42.68 
 
 
717 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  41.39 
 
 
717 aa  369  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 
709 aa  363  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 
709 aa  363  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 
996 aa  363  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 
832 aa  362  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 
1334 aa  359  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  38.79 
 
 
1991 aa  349  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  41.7 
 
 
728 aa  348  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  36.81 
 
 
731 aa  348  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  38.19 
 
 
857 aa  341  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 
790 aa  340  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
742 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
742 aa  337  7.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
1486 aa  336  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  38.13 
 
 
742 aa  336  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
734 aa  335  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 
721 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  34.48 
 
 
783 aa  331  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
794 aa  324  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  39.24 
 
 
880 aa  312  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  39.1 
 
 
958 aa  311  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
775 aa  311  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
1084 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
658 aa  284  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  32.39 
 
 
810 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
1297 aa  264  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.86 
 
 
1644 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.86 
 
 
1644 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
732 aa  257  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
2046 aa  246  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
725 aa  244  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
725 aa  241  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.45 
 
 
610 aa  232  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 
602 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
617 aa  216  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
684 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
586 aa  214  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
652 aa  213  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
662 aa  213  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
653 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
635 aa  204  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
555 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
531 aa  197  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
670 aa  197  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
1074 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  33.26 
 
 
1009 aa  193  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
556 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  33.26 
 
 
729 aa  190  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
551 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
748 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
526 aa  184  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
684 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
1359 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
1759 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 
551 aa  178  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
539 aa  177  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
576 aa  177  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.35 
 
 
809 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
796 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  41.3 
 
 
455 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  31.43 
 
 
1003 aa  164  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
1213 aa  164  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  30.96 
 
 
632 aa  161  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  33.25 
 
 
808 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  38.76 
 
 
708 aa  156  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.35 
 
 
1191 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  28.35 
 
 
1694 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 
783 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 
1198 aa  149  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  28.43 
 
 
972 aa  148  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
1193 aa  148  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
872 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
1190 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
1188 aa  139  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.31 
 
 
968 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  26.68 
 
 
974 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
968 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.19 
 
 
307 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
311 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
784 aa  119  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>