36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0536 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0536  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.326611  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0552  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  96.82 
 
 		 157 aa  300  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3527  poly granule associated  57.26 
 
 		 200 aa  146  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4024  poly granule associated  58.77 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3495  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  53.54 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.827909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0490  polygranule-associated protein  54.87 
 
 		 182 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394794  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2170  poly granule associated family protein  52.59 
 
 		 183 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0350  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  50.69 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1492  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  42.34 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  38.06 
 
 		 257 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2543  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  43.48 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00882865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0390  Poly granule associated  37.82 
 
 		 292 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5057  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  35.94 
 
 		 258 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  35.16 
 
 		 261 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  35.16 
 
 		 261 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0457  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  37.27 
 
 		 254 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0391  Poly granule associated  38.05 
 
 		 230 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0526  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  34.68 
 
 		 284 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5799  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  38.05 
 
 		 322 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  38.05 
 
 		 309 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0559  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  30.92 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0604  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  30.32 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5800  hypothetical protein  35 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00722  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  37.9 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66880  hypothetical protein  36.44 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5148  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaI  33.87 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0389  Poly granule associated  31.91 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0525  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  37.4 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5058  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.77 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5008  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.17 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0456  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.77 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4882  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.17 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4799  hypothetical protein  48.94 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2415  hypothetical protein  31.91 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01151  hypothetical protein  28.35 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.21 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.436738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>