More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0441 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  88.16 
 
 		 230 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  82.59 
 
 		 237 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  77 
 
 		 228 aa  338  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  67.61 
 
 		 255 aa  329  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  70.72 
 
 		 230 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  43.27 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  45.81 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  41.06 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  39.3 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  38.28 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  45 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  38.31 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  38.92 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  38.31 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  38.31 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  43.56 
 
 		 787 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  40 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  39.13 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  38.76 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  37.23 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  40.28 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  40.44 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  41.21 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  37.62 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  40.29 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  38.62 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  38.62 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  40.3 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  40.57 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  40.28 
 
 		 213 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  35.64 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.2 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  38.61 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  41.29 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  41.29 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  41.29 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  41.29 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  41.29 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  41.29 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  38.61 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  40.8 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  40.7 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  37.33 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  40.61 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  40.8 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  40.8 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  34.31 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  37.38 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  38.24 
 
 		 278 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  39.79 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  38.14 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  38.66 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  40.19 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  36.71 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  37.81 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  40.61 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  37.88 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  39.15 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  38.92 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  39.13 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  39.06 
 
 		 272 aa  134  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  37.95 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  34.8 
 
 		 356 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  37.04 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  37.73 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  37.86 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  38.12 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  37.45 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  38.68 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  38.61 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  35.96 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  39.11 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  36.76 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  39.11 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  38.35 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  37.02 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  34.63 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  36.89 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  39.59 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  39.61 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  35.61 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  36.23 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  35.82 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>