212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0199 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  83.99 
 
 		 449 aa  646    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  75.35 
 
 		 466 aa  646    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 447 aa  865    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  81.28 
 
 		 478 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  90.98 
 
 		 444 aa  687    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  75.29 
 
 		 466 aa  624  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  77.7 
 
 		 441 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  78.22 
 
 		 462 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  75.68 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  72.88 
 
 		 415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  73.15 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  61.62 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  63.38 
 
 		 461 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  58.12 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  56.31 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  55.88 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  56.08 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  56.11 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  56.62 
 
 		 471 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  57.01 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  57.01 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  54.39 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  56.44 
 
 		 466 aa  458  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  55.4 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  54.63 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  55.4 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  54.9 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  52.43 
 
 		 476 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  55.98 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  48.34 
 
 		 475 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  51.16 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  48.3 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 465 aa  352  8e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 468 aa  346  4e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  49.38 
 
 		 447 aa  342  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 478 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 443 aa  338  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  41 
 
 		 550 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 553 aa  322  6e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 		 482 aa  306  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 504 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 482 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  43.71 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 457 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 452 aa  263  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 455 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 443 aa  259  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  41.3 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  39.63 
 
 		 460 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  36.82 
 
 		 495 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  37.29 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  40.87 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  38.06 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  40.44 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  39.46 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  35.63 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  39.22 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  57.87 
 
 		 515 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 438 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  35.39 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  58.85 
 
 		 515 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  35.39 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  58.33 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  56.35 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  57.29 
 
 		 519 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  34.72 
 
 		 428 aa  226  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  35.63 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  35.63 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  35.39 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  35.39 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  35.39 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  35.39 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  35.63 
 
 		 491 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  35.39 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  35.39 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 450 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  33.26 
 
 		 491 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  35.92 
 
 		 491 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  35.92 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  35.92 
 
 		 491 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  35.92 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  35.92 
 
 		 491 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 416 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  46.89 
 
 		 1565 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  46.89 
 
 		 1565 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  58.85 
 
 		 598 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  30.98 
 
 		 424 aa  216  7e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  38.33 
 
 		 409 aa  216  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  57.43 
 
 		 550 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>