More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0074 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  283  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  99.29 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  72.14 
 
 		 140 aa  213  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  72.34 
 
 		 141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  64.29 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  62.14 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  69.29 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  52.86 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  51.77 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  43.26 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  34.53 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  37.59 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  30.22 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  33.09 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  32.37 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.81 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.86 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.41 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  28.17 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.96 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  28.78 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.5 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  34.25 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  37.35 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  32.67 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  28.78 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.39 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.9 
 
 		 305 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.65 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.43 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.39 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  35.46 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.19 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.99 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.7 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  27.54 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  29.71 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.28 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  30.22 
 
 		 306 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  31.03 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  30.56 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  28.67 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.55 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  26.45 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  30.22 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  28.97 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  28.08 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  25.71 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  35.16 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  29.5 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.35 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  27.59 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.69 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  27.59 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  35.16 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  35.16 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  35.16 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  30.87 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  35.16 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  35.16 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  30.92 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  35.16 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 283 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.07 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  29.09 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.34 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  28.26 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  36.62 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  51.85 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  29.86 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  28.77 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>