More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0054 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0107  acetoacetyl-CoA synthetase  61.43 
 
 
671 aa  903    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0764  acetoacetyl-CoA synthetase  50.14 
 
 
671 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3179  acetoacetyl-CoA synthetase  69.64 
 
 
695 aa  1023    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0119  acetoacetyl-CoA synthetase  70.07 
 
 
727 aa  1021    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3963  acetoacetyl-CoA synthetase  65.65 
 
 
711 aa  994    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0120  acetoacetyl-CoA synthetase  66.98 
 
 
696 aa  986    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666374  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0054  acetoacetyl-CoA synthetase  100 
 
 
754 aa  1536    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0087  acetoacetyl-CoA synthetase  71.12 
 
 
704 aa  1026    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387097  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0074  acetoacetyl-CoA synthetase  86.76 
 
 
695 aa  1281    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1970  acetoacetyl-CoA synthetase  43.96 
 
 
676 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0879  acetoacetyl-CoA synthetase  46.17 
 
 
664 aa  579  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.361725  normal  0.0726893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4421  acetoacetyl-CoA synthase  41.68 
 
 
656 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4482  acetoacetyl-CoA synthase  45.06 
 
 
662 aa  575  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.984378  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2270  acetoacetyl-CoA synthase  46.58 
 
 
654 aa  574  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2133  acetoacetyl-CoA synthase  43.05 
 
 
667 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569736  decreased coverage  0.00936242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0937  acetoacetyl-CoA synthetase  45.83 
 
 
665 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0152  acetoacetyl-CoA synthase  44.2 
 
 
651 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3920  acetoacetyl-CoA synthase  39.84 
 
 
649 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2342  acetoacetyl-CoA synthetase  41.94 
 
 
660 aa  535  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2245  acetoacetyl-CoA synthetase  43.66 
 
 
654 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3253  acetoacetyl-CoA synthase  41.84 
 
 
685 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1473  acetoacetyl-CoA synthetase  41.93 
 
 
637 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598373  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01880  acetoacetyl-CoA synthase  42.88 
 
 
673 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0304  acetoacetyl-CoA synthase  41.11 
 
 
667 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1154  acetoacetyl-CoA synthetase  39.4 
 
 
666 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  0.586098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5085  acetoacetyl-CoA synthetase  40.36 
 
 
643 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293812  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4700  acetoacetyl-CoA synthetase  40.36 
 
 
643 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4786  acetoacetyl-CoA synthetase  40.36 
 
 
643 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434813  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3504  acetoacetyl-CoA synthetase  40.95 
 
 
709 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.315612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0554  acetoacetyl-CoA synthase  38.69 
 
 
658 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3863  acetoacetyl-CoA synthase  40.41 
 
 
669 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556445  normal  0.0884622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1363  acetoacetyl-CoA synthase  38.78 
 
 
654 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2047  acetoacetyl-CoA synthetase  39.67 
 
 
651 aa  445  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0036  acetoacetyl-CoA synthetase  37.87 
 
 
662 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1610  acetoacetyl-CoA synthase  36.46 
 
 
651 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.787437  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0021  acetoacetyl-CoA synthetase  37.16 
 
 
662 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0018  acetoacetyl-CoA synthetase  37.03 
 
 
662 aa  439  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38690  acetoacetyl-CoA synthetase  37.86 
 
 
651 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3297  acetoacetyl-CoA synthetase  37.99 
 
 
651 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2108  acetoacetyl-CoA synthetase  38.07 
 
 
651 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.188473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0177  acetoacetyl-CoA synthetase  37.9 
 
 
651 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0168  acetoacetyl-CoA synthetase  36.87 
 
 
652 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3315  acetoacetyl-CoA synthase  37.25 
 
 
620 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2720  acetoacetyl-CoA synthetase  36.61 
 
 
653 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.0612564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1247  acetoacetyl-CoA synthase  37.35 
 
 
651 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.916706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2019  acetoacetyl-CoA synthase  38.28 
 
 
658 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000482159  normal  0.0114668 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0089  acetoacetyl-CoA synthetase  36.62 
 
 
662 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848036  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1795  acetoacetyl-CoA synthetase  35.38 
 
 
646 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3080  acetoacetyl-CoA synthetase  35.9 
 
 
651 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1794  acetoacetyl-CoA synthetase  35.01 
 
 
646 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2699  acetoacetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 
669 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4886  acetoacetyl-CoA synthase  32.51 
 
 
657 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3071  acetoacetyl-CoA synthetase  36.24 
 
 
650 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922751  normal  0.501607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2795  acetoacetyl-CoA synthetase  36.01 
 
 
652 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  0.10488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3889  acetoacetyl-CoA synthase  36.45 
 
 
653 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00052085  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2653  acetoacetyl-CoA synthetase  36.38 
 
 
650 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1953  acetoacetyl-CoA synthetase  50.86 
 
 
657 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1149  acetoacetyl-CoA synthase  36.15 
 
 
654 aa  390  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.335784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1658  acetoacetyl-CoA synthetase  37.43 
 
 
662 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3829  acetoacetyl-CoA synthetase  51.1 
 
 
657 aa  392  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0315  acetoacetyl-CoA synthetase  36.68 
 
 
650 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0655  acetoacetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 
684 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0699  acetoacetyl-CoA synthetase  51.56 
 
 
684 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0880431  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2277  acetoacetyl-CoA synthetase  46.96 
 
 
667 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1185  acetoacetyl-CoA synthetase  32.3 
 
 
650 aa  379  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0779  acetoacetyl-CoA synthetase  32.16 
 
 
650 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3695  acetoacetyl-CoA synthetase  36.23 
 
 
668 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1714  acetoacetyl-CoA synthetase  34.38 
 
 
687 aa  365  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.776218  normal  0.102104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0412  acetoacetyl-CoA synthetase  34.2 
 
 
650 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0370757  hitchhiker  0.0000659795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4892  acetoacetyl-CoA synthase  47.78 
 
 
666 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05420  acetoacetyl-CoA synthetase  31.89 
 
 
656 aa  347  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0406  acetoacetyl-CoA synthetase  31.91 
 
 
659 aa  347  6e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000302212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4181  acetoacetyl-CoA synthase  32.6 
 
 
646 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.166817  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4014  acetoacetyl-CoA synthase  46.65 
 
 
667 aa  337  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0246  acetoacetyl-CoA synthetase  42.34 
 
 
661 aa  336  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2192  acetoacetyl-CoA synthetase  45.79 
 
 
669 aa  332  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175358  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001479  acetoacetyl-CoA synthetase  30.69 
 
 
657 aa  331  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.525178  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000409  acetoacetyl-CoA synthetase  30.57 
 
 
695 aa  327  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3294  acetoacetyl-CoA synthetase  33.24 
 
 
676 aa  325  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0788  acetoacetyl-CoA synthase  44.93 
 
 
645 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6018  acetoacetyl-CoA synthase  44.58 
 
 
667 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1444  acetyl-CoA synthetase  42.67 
 
 
681 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1569  acetoacetyl-CoA synthetase  42.79 
 
 
664 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5298  acetoacetyl-CoA synthetase  42.76 
 
 
632 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
568 aa  306  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280007 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  32.15 
 
 
1021 aa  300  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0006  acetoacetyl-CoA synthetase  29.93 
 
 
646 aa  293  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.497617  normal  0.392863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1820  acetoacetyl-CoA synthetase  41.32 
 
 
649 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000185409  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1209  acetoacetyl-CoA synthetase  41.45 
 
 
665 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926672  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  30.3 
 
 
1056 aa  281  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0916  acetoacetyl-CoA synthase  31.75 
 
 
971 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2028  acetoacetyl-CoA synthetase  39.4 
 
 
651 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720983  normal  0.488067 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04900  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 
698 aa  264  4e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0443  acetoacetyl-CoA synthase  31.3 
 
 
988 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303442  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01482  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_8G04770)  28.53 
 
 
698 aa  263  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0380  acetoacetyl-CoA synthetase  36.27 
 
 
650 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044282 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01103  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_1G11880)  32.71 
 
 
690 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 
642 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  24.97 
 
 
646 aa  204  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  24.41 
 
 
646 aa  194  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>