32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0034 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0034  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  100 
 
 		 109 aa  218  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551832  normal  0.0979537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0054  cytochrome c, class I  77.23 
 
 		 115 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3017  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  62.16 
 
 		 107 aa  100  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4217  hypothetical protein  53.85 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2727  putative cytochrome c protein  53.12 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1286  cytochrome c class I  58.93 
 
 		 701 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  39.08 
 
 		 280 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2358  cytochrome c, class I  36.25 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4247  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  37.84 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  36.49 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  42.19 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  33.75 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1510  cytochrome c class I  52.63 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  35.38 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  36.9 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  41.25 
 
 		 294 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  38.67 
 
 		 285 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  33.33 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  39.06 
 
 		 97 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  39.68 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  35.48 
 
 		 344 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  34.38 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  44.29 
 
 		 385 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1132  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.300286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  33.66 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>