94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0033 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  98.84 
 
 		 346 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 346 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  82.66 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  83.49 
 
 		 356 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  70.26 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  77.3 
 
 		 299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  71.79 
 
 		 311 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.59 
 
 		 273 aa  266  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  47.77 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.99 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  46.01 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  40.66 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  44.1 
 
 		 277 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  44.86 
 
 		 275 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  44.39 
 
 		 275 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  44.39 
 
 		 275 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  44.39 
 
 		 275 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  44.39 
 
 		 275 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  44.39 
 
 		 275 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  44.39 
 
 		 275 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  44.13 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  39.71 
 
 		 268 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  34.78 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  35.37 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  35.65 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  34.39 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  45 
 
 		 217 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  30.58 
 
 		 292 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  45.59 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  42.86 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 		 466 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  34.71 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 		 474 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  48.21 
 
 		 406 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.94 
 
 		 393 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  42.71 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  42.03 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3803  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.98 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633002  normal  0.020318 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6252  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  48.84 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  48.84 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  47.27 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.27 
 
 		 1012 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.98 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3194  hypothetical protein  61.76 
 
 		 61 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  32.14 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  44 
 
 		 482 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 		 437 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  38.98 
 
 		 497 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  46.51 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  44.64 
 
 		 267 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 469 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  42.31 
 
 		 457 aa  46.2  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.9 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  29.21 
 
 		 478 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.44 
 
 		 1260 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1933  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.02 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  37.88 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  44.44 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  38.03 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0894  peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.15 
 
 		 457 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  32.41 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 1072 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  47.06 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  43.14 
 
 		 383 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3137  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 524 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 573 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.59 
 
 		 1263 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  48.84 
 
 		 2277 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 480 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  53.85 
 
 		 457 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 528 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  31.62 
 
 		 392 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  38.18 
 
 		 478 aa  42.7  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  41.18 
 
 		 576 aa  42.7  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  40.35 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.73 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>