More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0014 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  81.52 
 
 
394 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  98.99 
 
 
395 aa  795    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  100 
 
 
395 aa  803    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  86.8 
 
 
398 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  88.35 
 
 
395 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  72.45 
 
 
396 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  69.74 
 
 
421 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  66.58 
 
 
394 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  66.58 
 
 
394 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  68.86 
 
 
394 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  68.86 
 
 
394 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  66.58 
 
 
394 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  66.84 
 
 
394 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  68.61 
 
 
394 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  67.09 
 
 
394 aa  534  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  66.92 
 
 
394 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  64.89 
 
 
394 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  64.63 
 
 
394 aa  524  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  68.11 
 
 
409 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  65.14 
 
 
427 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  65.14 
 
 
394 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  65.14 
 
 
394 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  65.14 
 
 
394 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  65.14 
 
 
394 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  65.14 
 
 
427 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  67.34 
 
 
394 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  67.35 
 
 
394 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  64.89 
 
 
394 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  67.6 
 
 
397 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  64.89 
 
 
427 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  67.86 
 
 
397 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  67.35 
 
 
394 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  67.86 
 
 
397 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  67.35 
 
 
394 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  67.86 
 
 
397 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  65.06 
 
 
396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  67.35 
 
 
394 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  67.6 
 
 
397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  67.6 
 
 
397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  66.58 
 
 
394 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  64.71 
 
 
392 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  64.8 
 
 
395 aa  502  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 
396 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 
395 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  64.89 
 
 
395 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  63.27 
 
 
389 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  60.61 
 
 
392 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  62.03 
 
 
393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  59.85 
 
 
393 aa  461  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  59.85 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  63.68 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  58.21 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  62.76 
 
 
389 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  63.27 
 
 
400 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  57.44 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  56.12 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  58.93 
 
 
393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  56.52 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  58.23 
 
 
393 aa  438  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  56.46 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  55.36 
 
 
394 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  57.03 
 
 
393 aa  434  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  57.03 
 
 
391 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  59.08 
 
 
397 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  58.48 
 
 
395 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  57.18 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  53.92 
 
 
402 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
393 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
393 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 
392 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 
392 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
394 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
394 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
394 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
392 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
392 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
394 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
392 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
392 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
393 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2706  acetyl-CoA acetyltransferases  50 
 
 
394 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21761  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 
393 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
391 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
392 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
393 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
392 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
391 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
393 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
393 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
393 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
392 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
393 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
393 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
393 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
393 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>