More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0010 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
884 aa  1757    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.86 
 
 
880 aa  1031    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  64.81 
 
 
881 aa  1069    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  74.41 
 
 
883 aa  1202    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.37 
 
 
545 aa  637    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  99.43 
 
 
884 aa  1749    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  60.18 
 
 
545 aa  634  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  42.03 
 
 
1141 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
1146 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  41.07 
 
 
1146 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
1146 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
1146 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1146 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  40.5 
 
 
1145 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  39.12 
 
 
1142 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1145 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 
1146 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 
1146 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  42.5 
 
 
1150 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 
1159 aa  376  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 
1140 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  36.87 
 
 
1148 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
1140 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 
1172 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  41.38 
 
 
1157 aa  364  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  42.15 
 
 
1159 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
1140 aa  363  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  36.8 
 
 
1055 aa  363  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  42.15 
 
 
1159 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  36.45 
 
 
1177 aa  361  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  41.79 
 
 
1161 aa  360  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 
1152 aa  356  7.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1159 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 
1156 aa  356  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
1159 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  36.92 
 
 
1147 aa  353  7e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
1158 aa  353  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
1138 aa  348  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1159 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.57 
 
 
1158 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
1111 aa  336  9e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
1175 aa  334  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
1172 aa  330  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1168 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.01 
 
 
1156 aa  329  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1172 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1152 aa  325  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.58 
 
 
1179 aa  320  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
1116 aa  319  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1145 aa  320  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
1177 aa  319  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
1166 aa  317  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
1168 aa  317  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
1161 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  38.74 
 
 
1169 aa  308  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  41.4 
 
 
1006 aa  306  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  33.64 
 
 
1147 aa  306  9.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.18 
 
 
1168 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.71 
 
 
1169 aa  305  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
1168 aa  303  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  49.57 
 
 
588 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  49.71 
 
 
586 aa  300  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 
586 aa  300  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
1171 aa  296  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  35.84 
 
 
1174 aa  296  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1163 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
1185 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
1169 aa  295  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  45.6 
 
 
585 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
585 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1169 aa  290  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
1174 aa  289  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
1169 aa  289  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 
585 aa  287  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
585 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  47.28 
 
 
585 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  46.65 
 
 
585 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
733 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
733 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
1167 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
733 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1170 aa  282  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
1168 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.36 
 
 
1184 aa  275  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
1169 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 
567 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  35.73 
 
 
676 aa  267  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
591 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
556 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 
554 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
1316 aa  255  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
635 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
645 aa  253  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  34.14 
 
 
747 aa  251  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
655 aa  250  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  34.09 
 
 
842 aa  250  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  37.56 
 
 
487 aa  248  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  39.8 
 
 
868 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
854 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  40.1 
 
 
881 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>