More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2003 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_2003  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
412 aa  838    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0747762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  28.02 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.06 
 
 
385 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  28.44 
 
 
386 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  27.69 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1499  heterodisulfide reductase, subunit D  27.48 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0669416  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.8 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.03 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.42 
 
 
762 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.06 
 
 
717 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  27.11 
 
 
699 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  26.22 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  26.72 
 
 
716 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  28.09 
 
 
692 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.5 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  28.01 
 
 
688 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  28.04 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.97 
 
 
737 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  28.53 
 
 
730 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.52 
 
 
698 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  27.71 
 
 
716 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  29.79 
 
 
703 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.29 
 
 
699 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.18 
 
 
641 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  27.27 
 
 
727 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.66 
 
 
713 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  30.39 
 
 
629 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  27.17 
 
 
739 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  30.39 
 
 
703 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  30.39 
 
 
703 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  30.39 
 
 
703 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  30.39 
 
 
703 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  30.39 
 
 
703 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  30.39 
 
 
703 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  28.02 
 
 
752 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  30.39 
 
 
703 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  27.72 
 
 
661 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  30.39 
 
 
703 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  30.39 
 
 
703 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.25 
 
 
387 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.74 
 
 
494 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0980  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.72 
 
 
440 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  29.63 
 
 
703 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  27.38 
 
 
671 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  27.09 
 
 
678 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  24.8 
 
 
654 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.12 
 
 
722 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.48 
 
 
662 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.71 
 
 
743 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0952  hypothetical protein  27.05 
 
 
365 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.57 
 
 
748 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0717  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.49 
 
 
538 aa  99.8  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.942612  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  22.87 
 
 
494 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.2 
 
 
662 aa  99.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0470  hypothetical protein  24.25 
 
 
361 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  25.57 
 
 
1033 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.92 
 
 
494 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.87 
 
 
686 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  22.48 
 
 
494 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  30.06 
 
 
678 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.85 
 
 
721 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.79 
 
 
683 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.72 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  26.75 
 
 
727 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.87 
 
 
664 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  26 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  25.66 
 
 
652 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  28.37 
 
 
720 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.87 
 
 
664 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  28.27 
 
 
683 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  26.32 
 
 
718 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  27.23 
 
 
720 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.47 
 
 
656 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.56 
 
 
661 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  25.75 
 
 
658 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  24.59 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  24.41 
 
 
639 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  24.55 
 
 
663 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0771  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.26 
 
 
406 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0497692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  26.32 
 
 
732 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  23.37 
 
 
1015 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.25 
 
 
661 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.13 
 
 
774 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.67 
 
 
663 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  23.24 
 
 
659 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  28.28 
 
 
711 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.51 
 
 
663 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.2 
 
 
411 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.69 
 
 
712 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  21.45 
 
 
430 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.72 
 
 
656 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  28.51 
 
 
661 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.5 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  28.07 
 
 
762 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  25.14 
 
 
1388 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  25.72 
 
 
661 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.47 
 
 
442 aa  88.2  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0768  hypothetical protein  29.22 
 
 
385 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.47 
 
 
655 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>