More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1971 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1084 aa  2221    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  44.19 
 
 
1275 aa  433  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  41.81 
 
 
958 aa  433  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  44.76 
 
 
710 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  42.07 
 
 
1509 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 
625 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 
625 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 
723 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  44.76 
 
 
717 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  42.28 
 
 
709 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  42.28 
 
 
709 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 
1334 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  44.4 
 
 
717 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
632 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 
625 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.04 
 
 
1561 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 
765 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  38.65 
 
 
1152 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  38.65 
 
 
1152 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  42.36 
 
 
721 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
733 aa  379  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  42.36 
 
 
728 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 
1067 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  36.06 
 
 
746 aa  369  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  36.77 
 
 
731 aa  364  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  38.56 
 
 
1182 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
790 aa  356  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  42.53 
 
 
775 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  38.75 
 
 
988 aa  351  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 
658 aa  351  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  38.6 
 
 
1991 aa  351  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
734 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 
996 aa  343  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  36.3 
 
 
832 aa  339  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  37.81 
 
 
857 aa  326  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
742 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 
794 aa  315  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
742 aa  314  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
742 aa  311  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  33.51 
 
 
783 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 
983 aa  304  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  33.88 
 
 
810 aa  298  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  35.99 
 
 
880 aa  296  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
1486 aa  294  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  41.28 
 
 
956 aa  266  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
958 aa  261  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
1152 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
2046 aa  245  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 
617 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  38.41 
 
 
1119 aa  234  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.46 
 
 
1644 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.46 
 
 
1644 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 
732 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
602 aa  229  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  53 
 
 
1476 aa  228  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1814  hypothetical protein  47.26 
 
 
219 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1635  hypothetical protein  47.26 
 
 
219 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0150544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1613  hypothetical protein  47.26 
 
 
219 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1764  hypothetical protein  47.26 
 
 
219 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  56.52 
 
 
1236 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1893  hypothetical protein  47.76 
 
 
219 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00821908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1585  hypothetical protein  47.26 
 
 
219 aa  222  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1839  hypothetical protein  47.76 
 
 
219 aa  220  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
725 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  42.56 
 
 
518 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2733  glycosyltransferase-like protein  36.5 
 
 
329 aa  218  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
725 aa  214  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1634  hypothetical protein  45.05 
 
 
219 aa  213  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3565  hypothetical protein  45.05 
 
 
219 aa  212  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.876515  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1779  hypothetical protein  44.55 
 
 
219 aa  209  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
586 aa  202  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
1074 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0835  hypothetical protein  45.77 
 
 
223 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
1359 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
808 aa  195  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
729 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
994 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  29.98 
 
 
1297 aa  192  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 
576 aa  191  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  34.66 
 
 
632 aa  191  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.15 
 
 
809 aa  186  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
684 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.75 
 
 
610 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
1009 aa  184  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
556 aa  180  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
796 aa  180  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 
1759 aa  177  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
635 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 
684 aa  173  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 
670 aa  171  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
531 aa  171  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  38.13 
 
 
526 aa  160  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
783 aa  160  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
551 aa  159  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  36.88 
 
 
551 aa  158  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 
652 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 
555 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
1213 aa  153  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  37.08 
 
 
662 aa  153  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
539 aa  148  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>