More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1968 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 495 aa  948    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  37.63 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  35.8 
 
 		 511 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  35.8 
 
 		 502 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  35.8 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  34.81 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 461 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  29.14 
 
 		 461 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  28.95 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  28.95 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  28.95 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  28.95 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  28.95 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  28.15 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 461 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 482 aa  113  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  27.74 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  28.03 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 443 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  28.23 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.63 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 450 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 443 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 443 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 443 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 443 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 441 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  31.46 
 
 		 506 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.95 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 475 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.57 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  28.57 
 
 		 468 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 456 aa  90.1  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  30.33 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 516 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  26.7 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  30.06 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 459 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 453 aa  87  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 453 aa  87  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  28.21 
 
 		 463 aa  86.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 510 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 510 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 510 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 510 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  25.62 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.6 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  25.06 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  26.52 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.09 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  24.64 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>