More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1961 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  40 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  37.04 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  32.02 
 
 		 274 aa  98.2  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  37.06 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  36.3 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  36.3 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 192 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.53 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  36.36 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  36.42 
 
 		 172 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  36.42 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  28.72 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.77 
 
 		 248 aa  85.9  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  27.32 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  31.69 
 
 		 226 aa  85.1  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  34.93 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.31 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.96 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  39.06 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  33.12 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  31.74 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  38.85 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.46 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  29.84 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  32.06 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  33.09 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  37.98 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  32.04 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  35.62 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  33.14 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.79 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  39.58 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  34.81 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  31.17 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  30.61 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.16 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  37.88 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  34.85 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  30.46 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  28.74 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  34.04 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  33.1 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  35.17 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  30.49 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  39.85 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.91 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.19 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  35.44 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  39.71 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  36.72 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  35.17 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  30.27 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  39.1 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  34.85 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  34.93 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  32.17 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  30.99 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  30.99 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  32.35 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  36.42 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  35.56 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  36 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  39.1 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  39.1 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  32.14 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  27.91 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  39.1 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  28.93 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  29.3 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  33.59 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  34.56 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  34.06 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  33.09 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.49 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>