More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1942 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1942  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
478 aa  961    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0094  amidophosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
544 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
502 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  53.56 
 
 
500 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
484 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  53.6 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  52.7 
 
 
505 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
517 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  48.38 
 
 
488 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  52.68 
 
 
513 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
482 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
515 aa  438  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
515 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
514 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7210  amidophosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
623 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  53.08 
 
 
478 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
498 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
496 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  52.64 
 
 
534 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  53.07 
 
 
515 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
511 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
512 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  50.42 
 
 
525 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
511 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
514 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
511 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
527 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
526 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
519 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  48.94 
 
 
500 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
526 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
563 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 
512 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
518 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
558 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
517 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  48.93 
 
 
496 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
511 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
487 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
510 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
475 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
451 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  46.65 
 
 
496 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 
488 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  46.72 
 
 
474 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  47.21 
 
 
468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  48.4 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  45.71 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  47.41 
 
 
494 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  45.32 
 
 
499 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
470 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
475 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  47.84 
 
 
470 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  47.41 
 
 
494 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  47.32 
 
 
493 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  43.96 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
477 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  46.65 
 
 
492 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
493 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
488 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  47.3 
 
 
466 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
477 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18600  amidophosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
537 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
471 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  48.36 
 
 
469 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
466 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  47.81 
 
 
503 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  45.11 
 
 
495 aa  393  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
482 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  44.78 
 
 
473 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  45 
 
 
474 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
480 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
473 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  44.01 
 
 
475 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
471 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  44.35 
 
 
467 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  45.38 
 
 
468 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
485 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  48.16 
 
 
485 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
478 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
485 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  43.64 
 
 
503 aa  385  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
484 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
478 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0004  amidophosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
501 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
472 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
472 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  47.58 
 
 
465 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  46.48 
 
 
472 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>