236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1907 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1907  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 
270 aa  519  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  46.92 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  44.66 
 
 
255 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  45.21 
 
 
264 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  48.28 
 
 
254 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  41.98 
 
 
255 aa  222  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.74 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  42.53 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  46.64 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  41.76 
 
 
262 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  41 
 
 
262 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  39.31 
 
 
256 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  42.05 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  41.38 
 
 
262 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  41.38 
 
 
262 aa  215  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  41.38 
 
 
262 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  41.38 
 
 
262 aa  215  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  41.38 
 
 
262 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  41.38 
 
 
262 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  41.38 
 
 
262 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  41.76 
 
 
262 aa  214  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  40.75 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  40.75 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  41.38 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  40.15 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  41.54 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  40.15 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  48.47 
 
 
262 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  44.83 
 
 
254 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  45.15 
 
 
260 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.31 
 
 
254 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  43.68 
 
 
255 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  47.35 
 
 
253 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  43.66 
 
 
262 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  42.15 
 
 
255 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  40.82 
 
 
274 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  43.23 
 
 
260 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  41.38 
 
 
254 aa  205  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  41.92 
 
 
257 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  40.23 
 
 
255 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  37.79 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  42.42 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  38.15 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  40.08 
 
 
254 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  41.92 
 
 
256 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  44.02 
 
 
250 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  41.98 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  40.08 
 
 
254 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  40 
 
 
256 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  42.48 
 
 
260 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  41.89 
 
 
255 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.79 
 
 
261 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  41.35 
 
 
255 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  39.62 
 
 
264 aa  188  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  39.85 
 
 
254 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  42.64 
 
 
254 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  43.17 
 
 
254 aa  185  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.15 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  40.08 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.64 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  40.15 
 
 
263 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  39.54 
 
 
263 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  37.92 
 
 
263 aa  178  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  41.92 
 
 
254 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  40.61 
 
 
254 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  40.61 
 
 
254 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  40.23 
 
 
254 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  38.11 
 
 
258 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  40.46 
 
 
255 aa  175  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4713  Baf family transcriptional activator  42.59 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.073438  hitchhiker  0.000383315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  42.54 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  40 
 
 
253 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  40.77 
 
 
257 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  35.47 
 
 
255 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  39.08 
 
 
257 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  39.08 
 
 
257 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  40.08 
 
 
257 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  37.45 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  39.69 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  39.08 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5362  pantothenate kinase  39.03 
 
 
271 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331999  normal  0.0497904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  39.86 
 
 
285 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  39.41 
 
 
264 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  38.52 
 
 
255 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  36.4 
 
 
260 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0636  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.7 
 
 
273 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4760  pantothenate kinase  40.22 
 
 
267 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4846  pantothenate kinase  40.22 
 
 
267 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5146  pantothenate kinase  40.22 
 
 
267 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1426  pantothenate kinase  39.48 
 
 
270 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1063  pantothenate kinase  34.22 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  36.09 
 
 
256 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  37.36 
 
 
260 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  38.52 
 
 
266 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  37.79 
 
 
260 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.08 
 
 
255 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.71 
 
 
266 aa  148  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.18 
 
 
252 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  34.07 
 
 
259 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13632  pantothenate kinase  37.74 
 
 
272 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.3574e-61  normal  0.0267284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>